Сравнительный мониторинг является более сложным видом мониторинга как по форме, так и по содержанию. Это связано с использованием в процессе сбора, верификации, обработки и анализа сведений о выделенном (изолированном) объекте информации, о состоянии и поведении одного или нескольких идентичных или сходных (аналогичных) объектов. Наблюдение за выделенным объектом и его аналогами производится параллельно одними и теми же методами, средствами и способами на протяжении сопоставимых временных интервалов или же одновременно. Сравнительный мониторинг является эффективным инструментом выявления закономерностей и причинно-следственных связей, а также обнаружения различных флуктуаций, аномалий и побочных эффектов. Сравнительный мониторинг позволяет вести поиск источников и факторов развития объекта наблюдения с помощью прикладных математических методов, что существенно повышает достоверность результатов и обоснованность конечных выводов.
В рамках комплексного мониторинга применение прикладных математических методов, моделей, алгоритмов и критериев обработки информации органично сочетается с использованием средств, способов и приемов сбора сведений об объекте наблюдения. Комплексный мониторинг является наиболее сложным и потенциально эффективным видом мониторинга. В настоящее время применение данного вида мониторинга расценивается скорее как искусство, что серьезно ограничивает сферу его практического применения.
Все виды мониторинга с точки зрения приоритетности можно подразделить на стратегические, как правило, охватывающие широкий круг вопросов и имеющие значительный временной горизонт, и тактические, предназначенные для решения оперативных, обычно краткосрочных задач. Стратегический мониторинг по своей сути является проблемно ориентированным и нацелен на решение задач развития, а тактический мониторинг ограничивается отдельными частными задачами функционирования.
В зависимости от характера задач, решаемых на основании результатов наблюдений, выделяют также сопровождающий и проблемный мониторинг. Сопровождающий (текущий, фоновый) мониторинг предназначен собственно для слежения за состоянием и динамикой объекта наблюдения, выявления тенденций, угроз и сигнализации о возникновении потенциально и безусловно опасных ситуаций. Для сопровождающего мониторинга характерно постоянное слежение за ограниченным фиксированным числом параметров (показателей, индикаторов) объекта наблюдения.