Основным источником сведений об этом замечательном подвижнике является житие преподобного Мартиниана, созданное в Ферапонтовом монастыре еще в первой половине XVI века. Автором жития был ферапонтовский инок Матфей, написавший канон и всю службу преподобному. До нашего времени дошло всего 8 списков жития прп. Мартиниана, относящихся к XVI–XIX вв. Наиболее древний из них, по мнению исследователей[1], список XVI века из Волоколамского собрания, хранящийся в рукописном собрании Российской государственной библиотеки. Особая ценность этого памятника русской агиографии заключается в том, что в качестве источников жития Матфей использовал устные предания ферапонтовских старцев, которые могли с молодости помнить святого, о чем прямо и говорит сам автор жития: «И друга (другой) брат поведа ми… уже старец ныне, болии 30 лет дръжа игуменства»[2]. Здесь, скорее всего, имеется в виду игумен Геннадий, державший игуменство в Ферапонтовом монастыре с 1481 по 1510 год, доживший в монастыре до глубокой старости и хорошо помнивший прп. Мартиниана. Кроме того, Матфей использовал житие прп. Кирилла Белозерского и некоторые летописи, возможно, из Кирилло-Белозерского летописца. В настоящее время житие прп. Мартиниана издано с научными комментариями Институтом русской литературы[3].

Подризник преподобного Мартиниана. Кирилло-Белозерский музей-заповедник
Другим изданием, в котором содержатся сведения о жизни прп. Мартиниана, является книга И. И. Бриллиантова, написанная к пятисотлетнему юбилею Ферапонтова монастыря и посвященная в основном истории монастыря и его древним памятникам. О юношеском периоде жизни прп. Мартиниана, когда он был учеником прп. Кирилла и жил в его монастыре, можно найти сведения в житии прп. Кирилла Белозерского, которое было написано в 1462 году известным писателем-агиографом Пахомием Логофетом.
Автор составил житие из рассказов многих очевидцев жизни святого Кирилла, которых он еще застал среди насельников его обители, и лично беседовал с ними, записывая их рассказы. Одним из главных рассказчиков был сам прп. Мартиниан, поведавший Пахомию о некоторых памятных ему событиях. Кроме того, сохранилось насколько грамот на имя игумена Мартиниана, относящихся как к периоду его жизни в Ферапонтовом монастыре, так и ко времени игуменства в Троице-Сергиевой обители. Грамоты раскрывают круг практических дел по управлению монастырями, содержат имена людей, которых прп. Мартиниан хорошо знал, людей, которые могли оказать на него определенное влияние и на которых повлиял он сам. До нашего времени дошли книги, написанные рукой прп. Мартиниана, и даже некоторые вещи, ему принадлежавшие. В Кирилло-Белозерском музее в настоящее время хранится посох, подризник и фелонь прп. Мартиниана.