Наиболее сложным периодом в истории Борчалы можно считать XVIII век. Это связано с тем, что во время «избрания» в феврале 1736 года шахом Надир-хана, свергшего с шахского трона Сефевидов и узурпировавшего власть, против выступил очень влиятельный род Зиядоглу, представители которого традиционно являлись беглярбеками (наместниками) Гянджи и Карабаха. Через год после этого злопамятный Надир-шах в отместку отнял у них земли Борчалинского и Газахского султанств и переподчинил своему вассалу, грузинскому царю Теймуразу II.
С распадом государства Надир-шаха после его убийства в 1747 г. в Азербайджане образовалось более двух десятков ханств и султанств, в том числе Борчалинское султанство. В состав султанства входили Гараязы (Гардабани), Сарван (Марнеули), Агбулаг (Тетрицкаро), Болниси, Дманиси, а также Джалалоглу, Барана, Ташир и Хамамлы, ныне как административные единицы находящиеся в составе Армении. Передача Борчалы сначала под управление царя Картли, а затем междоусобица между ханствами стали причиной переселения из Борчалы части тюркского населения. Этот процесс даже усилился после смерти в 1747 году Надир-шаха. Такое положение беспокоило царя Картли и Кахетии Ираклия II, опасавшегося обезлюдения податных селений, и он просил старшин селений не оставлять страну (18). Несмотря на просьбы царя, немало семей покинули родные земли и переселились в Турцию и Иран.
Переселение азербайджанцев из Грузии приняло более массовый характер после присоединения Южного Кавказа к России. Этот процесс с определенным усилением и ослаблением продолжался до установления советской власти в Грузии. Так, весной 1828 года более 800 семей гарагапаглы переселились из Борчалы в область Тебриза. При условии выплаты наместнику Азербайджана и наследному принцу Аббас Мирзе 12 тыс. тюменов золотом, а также службы в его войске 400 всадников со своим снаряжением они были поселены в регионе Сулдуз. Что касается Турции, то, по данным турецкого исследователя, профессора А.Б. Арджиласуна, прибывшие из Южного Кавказа беженцы поселились в основном в Карсской провинции. И сейчас здесь имеются 92 селения, большая часть которых носит названия, совпадающие с названиями оставленных ими родных селений в Борчалы (19). О последующей волне переселений М.Ф. Кырзыоглу пишет: «…прибывшие в 1920–1921 гг. в качестве беженцев, а после 1924 года в результате обмена 45 тысяч тюрков нашли приют и возможность спокойной жизни на землях Карса. Это были гарага-паглы, выходцы из регионов Агбаба, Борчалы-Лори и Гараязы» (20).