Важнейшим является принцип централизации деятельности. Поскольку деятельность Банка России носит общенациональный характер, звенья его структуры должны руководствоваться указаниями одного главного центра, обладающего соответствующими полномочиями. Таким центром – высшим органом управления – выступает Совет директоров Банка России (см. приложение).
В Совет директоров входят Председатель Банка России и 12 членов Совета директоров, работающих в Банке России на постоянной основе. Председатель Банка России назначается на должность Государственной Думой по представлению Президента РФ; члены Совета директоров – Государственной Думой по представлению Председателя Банка России, согласованному с Президентом РФ. Совет директоров проводит заседания не реже одного раза в месяц. Срок полномочий членов Совета директоров – четыре года.
Наряду с принципом централизованного построения отчетливо просматривается принцип разделения властных полномочий по соответствующим уровням, образующим вертикальную структуру управления. Помимо первого уровня органов управления в иерархии власти и полномочий выделяются другие уровни (звенья): территориальные учреждения Банка России и РКЦ (второй уровень); полевые учреждения (третий уровень); учреждения инфраструктуры (вычислительные центры, инкассация, хранилища, образовательные учреждения и др.) (четвертое звено).
Назначение должностных лиц и их подчиненность осуществляются по вертикали. Нижестоящие структуры единой системы Банка России подчиняются вышестоящим органам Банка России, не имея каких-либо горизонтальных связей подчиненности местным органам власти и управления.
Важнейшим принципом организационного построения Банка России является функциональный принцип, обусловленный самим предметом его деятельности. Пример этого принципа в деятельности Банка России – распределение обязанностей между заместителями Председателя Банка России по направлениям деятельности, а также делегирование полномочий в области денежно-кредитного регулирования территориальным учреждениям Банка России и их РКЦ.
Большое значение в организации деятельности Банка России имеет принцип его согласования с интересами других экономических субъектов. При обособленности статуса Банка России он в своей деятельности неизбежно сталкивается с другими экономическими субъектами, их задачами и интересами. Этот принцип требует от Банка России такой организации управления, которая, с одной стороны, учитывала бы, насколько это возможно, интересы других субъектов, а с другой – не противоречила, не мешала бы выполнению его главных целей и задач.