Дальше указывалось, что для исправления этого положения необходимо образовать при ВЧК «„Специальный отдел“, штаты в коем утверждал председатель ВЧК. Начальник Специального отдела назначается Совнаркомом».
Все основные задачи, решаемые этим специфичным подразделением органов госбезопасности, были распределены на две категории: «постановка шифровального дела» и «постановка расшифровального дела» в РСФСР.
«А. Научная разработка вопросов шифровального дела:
а) анализ всех существующих и существовавших русских и иностранных шифров;
б) создание новых систем шифров;
в) составление описаний шифров и инструкций шифровальному делу и пользованию шифрами;
г) собирание архивов и литературы по шифровальному делу для сконцентрирования такового при Спецотделе;
д) составление и издание руководств по вопросам шифрования.
Б. Обследование и выработка систем шифров:
1. Обследование всех действующих в настоящее шифров и порядка пользования ими шифрорганами;
2. Окончательная обработка инструкций по шифровальному делу и пользованию шифрами и выработка правил работы шифрорганов;
3. Распределение вновь выработанных систем шифров между всеми ведомствами.
В. Организация учебной части:
1. Выработка программы школы шифровальщиков;
2. Создание школы шифровальщиков;
3. Укомплектование школы преподавателями и учебниками.
Г. Учет личного состава шифровальных органов. Наблюдение за закономерной постановкой шифровального дела. Инструктаж и инспекция шифровальных органов:
1. Учет и проверка всех сотрудников всех шифрорганов;
2. Распределение всяких сотрудников всех шифрорганов между последними, в зависимости от индивидуальных качеств каждого работника и фактической потребности в работниках в том или ином шифроргане, а также зависимо от государственной важности каждого учреждения;
3. Чистка неблагонадежного и неспособного элемента из всех шифрорганов;
4. Наблюдение за закономерной постановкой шифровального дела во всех шифрорганах;
5. Инструктировка и инспекция всех шифрорганов и проведение в жизнь Инструкции и правил по шифровальному делу».