В соответствии с п. 6.1. приказа Генерального прокурора РФ от 5 июля 2002 г. № 39 при рассмотрении прокурорами вопросов о даче органам предварительного расследования согласия на возбуждение перед судом ходатайства об избрании меры пресечения в виде заключения под стражу они обязаны тщательно проверять доводы подозреваемого и обвиняемого об их невиновности, оказании давления, нарушении права на защиту и др. В необходимых случаях прокуроры обязаны лично допрашивать лицо, подлежащее аресту, а несовершеннолетнего – в обязательном порядке. По смыслу уголовно-процессуального закона, приложений к нему предполагается, что по групповым делам ходатайство об избрании меры пресечения в отношении подозреваемого, обвиняемого составляется и разрешается судьей отдельно в отношении каждого из них. Следовательно, рассмотрение вопроса о заключении подозреваемых, обвиняемых под стражу по групповым делам, процесс в отношении каждого подозреваемого, обвиняемого проводится в отдельности.
По ходу проведения судебного заседания секретарем судебного заседания ведется протокол, в котором полно и объективно должен быть отражен ход рассмотрения ходатайства, включая вопросы, которые задавались судом участникам процесса. Допрос подозреваемого, обвиняемого сторонами защиты и обвинения на данном этапе уголовного судопроизводства законом не предусмотрен. Вместе с тем существует практика использования показаний подозреваемого, обвиняемого в судебном заседании при решении вопроса о заключении их под стражу в качестве доказательства по уголовным делам и при постановлении приговора. При рассмотрении ходатайства о заключении под стражу судье необходимо внимательно выслушать, а секретарю судебного заседания – подробно записать в протокол пояснения подозреваемого, обвиняемого по существу обвинения или подозрения, в том числе его доводы, почему он не согласен с позицией стороны обвинения. Выслушав всех участников процесса с учетом их права на реплику, судья удаляется в совещательную комнату, где выносит одно из следующих постановлений: 1) об избрании в отношении подозреваемого или обвиняемого меры пресечения в виде заключения под стражу; 2) об отказе в удовлетворении ходатайства; 3) о продлении срока задержания. Вынесенное в совещательной комнате постановление подлежит оглашению в судебном заседании. Анализируя полученные в судебном заседании данные, судья не вправе игнорировать доводы подозреваемого (обвиняемого), его защитника и законного представителя, а также иные обстоятельства, опровергающие или ставящие под сомнение обоснованность и законность задержания (обвинения). Задержанный (обвиняемый), его защитник и законный представитель могут представить непосредственно в суд соответствующие данные, необходимые, по их мнению, для правильного и объективного разрешения ходатайства. В итоговом документе судья обязан проанализировать все доводы сторон, мотивируя, почему одни из них были приняты им во внимание, а другие – отвергнуты. Часть 1 ст. 108 УПК прямо предписывает, что при избрании меры пресечения в виде заключения под стражу в постановлении судьи должны быть указаны конкретные фактические обстоятельства, на основании которых судья принял такое решение. Постановление о заключении подозреваемого (обвиняемого) под стражу в любом случае должно содержать суждение судьи о том, почему заключаемому под стражу лицу не может быть избрана менее строгая мера пресечения.