Его приход к власти способствовал окончательному отстранению сторонников реформ от участия в политическом процессе и привело к концентрации власти в руках верховного руководителя Ирана аятоллы С. Хаменеи.
Дискриминирующие законы и практика по-прежнему являлись причиной политической и социальной нестабильности, а также нарушений прав человека, в особенности затрагивающих представителей оппозиции, этнических и религиозных меньшинств.
За 2005 год в Иране казнили 94 осужденных, в том числе, 8 не достигших к моменту совершения преступления 18 лет. По данным «Международной амнистии» было вынесено «множество смертных приговоров, в т. ч., 11 несовершеннолетним». Суды продолжали выносить смертные приговоры за деяния, определяемые такой, например, расплывчатой формулировкой, как «моральное разложение на земле».
Еще в январе 2005 года Комитет ООН по правам ребенка призвал Иран срочно приостановить исполнение смертных приговоров в отношении совершивших преступления в возрасте до 18 лет и запретить применение к таким лицам смертной казни. Несмотря на заявление Ирана о том, что в отношении таких лиц действует мораторий, 17-летний И. Фаррохи был казнен именно в тот день, когда Комитет ООН заслушивал по этому вопросу доклад Ирана.
В результате протестов в стране и за рубежом некоторым женщинам и лицам, не достигшим к моменту совершения преступления 18 лет, такие приговоры либо отменили, либо предоставили отсрочку их исполнения.
В 2006 году в стране казнили 177 человек, включая 4 осужденных, совершивших преступления до достижения 18 лет. Смертные приговоры выносились за контрабанду наркотиков, вооруженный грабеж, убийства, за сексуальные преступления и политически мотивированные проявления насилия. Между тем о специфической практике выбора мер наказания говорят сообщения правозащитных организаций, подтверждающие факты вынесения приговоров суда к отсечению конечностей и выкалыванию глаз.
Распространенным наказанием по-прежнему оставалась и порка кнутом. В феврале Лейлу Мафии приговорили к 99 ударам кнута и привели приговор в исполнение. С восьми лет ее принуждали заниматься проституцией и неоднократно насиловали, а в начале 2004 года арестовали по обвинению в «деяниях, противоречащих принципам целомудрия». Тогда ее приговорили к смерти через побитие кнутом. И лишь под давлением мировой общественности смертный приговор был отменен.