Для исследования функций органов и тканей используются другие методы диагностики, включающие как исследования крови (определение ферментов печени, гормонов эндокринных желез), мочи (общий анализ, пробы по Зимницкому, Нечипоренко, биохимическое исследование на соли), кала (копрология, на углеводы, на кишечную микрофлору) и других биологических жидкостей, так и инструментальные исследования (ЭКГ – электрокардиография, ЭЭГ – электроэнцефалография, миография, исследование функции внешнего дыхания).
Особняком стоят микробиологические исследования. Микроорганизмы начинают заселять кожу и слизистые оболочки уже во время рождения. Всю свою жизнь человек имеет контакты с самыми разными микробами, многие из которых до сих пор не изучены. Микроорганизмы могут быть друзьями и помощниками человека, как, например, бифидобактерии, лактобактерии и кишечная палочка, заселяющие кишечник и выполняющие огромный объем работы по нейтрализации того, что не должно попасть в кровь из кишечника, выработке ферментов и витаминов, обеспечении нормальной моторики кишечника. Есть среди микробов условно-патогенные бактерии. Для того, чтобы проявить свою патогенность им нужны условия: либо их количество превысило пороговые значения, либо они оказались не там, где им положено жить (например, эпидермальный стафилококк, нормальный для кожи, заселил кишечник), либо организм ослаб, чтобы сопротивляться и компенсировать вредное воздействие этих микробов. Наконец, существуют патогенные микробы, которые при попадании в организм вызывают заболевание.
В диагностике инфекционных заболеваний существуют два направления: 1) выявление возбудителя (выращивание его вне организма – микробиологический или бактериологический посев; обнаружение в отделенном от организма «веществе» (слюне, моче, крови и пр.) генетически уникального кусочка ДНК микроба методом ПЦР – полимеразной цепной реакции) или токсинов, продуктов жизнедеятельности, уникальных молекул структур микроба (антигенов); 2) выявление специфической реакции иммунной системы на конкретного возбудителя – определение антител – иммуноглобулинов (антитела – белки иммунной системы, обладают высокой специфичностью, то есть на каждый микроорганизм вырабатываются «свои» иммуноглобулины разных классов в зависимости от длительности инфицирования). Определение антигенов и антител проводится высокоточными иммунологическими методами: ИФА – иммуноферментный анализ, РСК – реакция связывания комплимента, РПГА – реакция прямой агглютинации и др. При помощи микробиологических исследований можно выявить чувствительность микроба к антибиотикам и другим противомикробным препаратам, стадию развития заболевания, а также проконтролировать эффективность лечения и состояние иммунологической памяти. Также можно выявить эффективность прививок, посмотрев методом ИФА наличие в крови антител к возбудителям тех инфекционных заболеваний, от которых производилась вакцинация.