После мексиканской войны последовал длительный период мира, и Джексон оказался в Виргинском военном институте, где в течение десяти лет преподавал военное дело и другие предметы. И одновременно учился сам, расширяя свои познания по военной стратегии и тактике. Будучи солдатом, он не вел разгульного образа жизни, никогда не нарушал церковные заповеди и был глубоко религиозным членом общины пресвитерианской церкви. Джексон всегда проявлял немалую доброту к рабам, преподавая им библейскую мудрость на занятиях в воскресной школе при пресвитерианской церкви.
В 1861 году наступил кризис в отношениях Севера и Юга. Джексон не мог не проявить верности своей родной Виргинии и вступил в армию Юга. Он получил назначение пехотного полковника, а спустя несколько месяцев – уже бригадного генерала.
Джексон понимал, что генерал, какими бы блестящими талантами он ни обладал, никогда не сумеет сделать больше, чем готовы выполнить его солдаты. Поэтому он сконцентрировался на обучении своих солдат. Томас Джексон настолько хорошо подготовил солдат под своей командой, что, столкнувшись с ужасным огнем федеральных войск в сражении при реке Булл-Ран, они твердо стояли на своих позициях, когда другие соединения пускались наутек. За эту их стойкость под огнем неприятеля к Джексону навсегда прикрепилось прозвище Каменная Стена.
Сражение за сражением Джексон показывал себя достойным того доверия, которое оказали ему южане. Уверенность в себе и успех были заложены в его природе. Ему приписывают главную роль в остановке продвижения Макклеллана на Ричмонд. Возможно, Конфедерация проиграла бы без него и второе сражение на реке Булл-Ран. Генерал Роберт Эдвард Ли называл его своей верной правой рукой. Северяне опасались Джексона, как никого другого.
Но там, где тактика, стратегия и храбрость врага оказались не в состоянии причинить вред бесстрашному Джексону Каменная Стена, преуспела глупость сподвижников. После самого успешного своего сражения в Уайлдернессе (Битва в глуши), близ Чанселорвилла, Томас Джексон встретил случайную смерть. Когда с наступлением темноты он со своими офицерами выехал для осмотра вражеских позиций, дозорные конфедератов приняли их за северян и открыли огонь, смертельно ранив своего генерала.
Если вам доведется когда-нибудь путешествовать по южным штатам, вам встретится несколько великолепных памятников генералу Джексону. Но больше всего впечатляет памятник в Ричмонде. Первый взнос на его создание поступил из баптистской конгрегации негритянских рабов, к которым он проявлял столько доброты в те дни, когда преподавал в Военном институте в Виргинии.