Тем не менее неизвестно ни одного случая оспаривания каких-либо из торговых мер, применяемых в целях сохранения глобальных ресурсов рыболовства. Более того, Секретариат ВТО пришел к выводу, что торговые меры, применяемые в АНТКОМ и ИККАТ, могут «считаться примером целесообразного и соответствующего принципам ВТО (т. е. недискриминационного) использования торговых мер в многосторонних природоохранных соглашениях». С другой стороны, Комитет по торговле и окружающей среде должен еще согласиться с оценкой Секретариата, а значит, дискуссия по вопросам торговых мер, связанных с рыболовством, продолжается.
Поскольку соглашения ВТО являются межгосударственными, они не должны применяться к частным добровольным программам экомаркировки, как, например, маркировка MSC (Marine Stewardship Council). Это означает, в частности, что при условии разработки инициатив частного сектора в ходе консультации с правительствами (или даже получения финансовой поддержки от них) это повышает вероятность юридических проблем в соответствии с правилами ВТО. Согласно правилам ВТО, схожие продукты должны быть урегулированы схожим образом. С точки зрения классификации ТБТ (Соглашения по техническим барьерам в торговле в рамках ВТО) это означает, что продукты с аналогичными характеристиками должны быть урегулированы таким же образом. Маркировка MSC, однако, как и большинство экомаркировок, имеет целью информировать потребителей не только о том, что это за продукт, но и как он был произведен, т. е. проникает «за» сам продукт и уведомляет о том, насколько ответственными являются рыбаки, которые осуществляли вылов, насколько хорошо рыболовство регулируется (управляется) и каковы последствия промысла для окружающей среды. Поэтому есть основания для конфликта с положениями ВТО.
Конечно, правила ВТО не были предназначены для предотвращения наложения различных требований (в том числе тех, которые относятся к маркировке) на продукты, имеющие различные характеристики. Но там, где требования касаются вещей, которые не имеют никакого отношения к коммерческой или даже практической взаимозаменяемости товара, а касаются того, как товар производится, дискриминация возникает, они теоретически могут противоречить правилам ВТО.
Стоит подчеркнуть, однако, что не все так однозначно и здесь. Это отмечается, например, в докладе Апелляционного органа ВТО по делу о креветках и черепахах: устранено ограничение на меры по переработке и производству для разработки экологических норм до тех пор, пока они будут реализованы таким образом, чтобы соответствовать правилам ВТО. Позиция такова, что если отсутствуют связанные с ВТО ограничения на меры экологического характера, касающиеся переработки и производства, то не должно возникать сложностей с использованием экомаркировки для аналогичных ситуаций (подходов).