Национально-освободительная борьба греков против турецкого господства, особенно после греческой национально-освободительной революции 1821—1829 гг., охватила также и греческое население Македонии. Возникло и освободительное движение славян Македонии, направленное как на свержение османского ига, так и против эллинизации, проводимой константинопольской патриархией.
2 августа 1903 г. в Македонии, в районе Битолы началось Илинденское национально-освободительное восстание, завершившееся провозглашением Крушевской Республики (просуществовала 10 дней) и созданием Временного революционного правительства во главе с Н. Каревым. Но это восстание через три месяца было жестоко подавлено турецкими войсками.
В результате Балканских войн 1912—1913 гг. Македония была освобождена от османского ига и разделена, по условиям Бухарестского мирного договора, между Сербией (центральная и северная часть – Вардарская Македония), Грецией (южная часть с побережьем Эгейского моря – Эгейская Македония) и Болгарией (восточная часть – Пиринский край).
Этот раздел Македонии был закреплен после I мировой войны Версальским договором, поэтому в 1918 г. Вардарская Македония стала частью Королевства сербов, хорватов и словенцев (с 1929 г. – Королевство Югославия).
В 1941 г., после оккупации Югославии германскими войсками, западная часть Вардарской Македонии была формально присоединена к Албании (фактически – к Италии), восточная часть Вардарской Македонии и часть юго-восточной Сербии были оккупированы Болгарией, остальные районы – Италией (с 8 сентября по 13 ноября 1944 г. на территории Македонии существовало марионеточное государство).
В сентябре 1941 г. в Вардарской Македонии был создан краевой штаб освободительной войны против оккупантов, который действовал совместно с югославской народно-освободительной армией. В 1944 г. Вардарская Македония была освобождена от оккупантов и в апреле 1945 г. здесь было образовано первое народное правительство Македонии, а 29 ноября 1945 г. Учредительное собрание Югославии провозгласило образование Федеративной Народной Республики Югославии (ФНРЮ) и Вардарская Македония стала самостоятельным субъектом в ее составе – Народной Республикой Македонией.
В апреле 1963 г. Македония стала социалистической республикой в составе Социалистической Федеративной Республики Югославии (СФРЮ).