Спасо-Андроников монастырь. Худ. В. Тимофеев. 2004 г.
В этот период святитель Алексий и преподобный Сергий начинают вместе воплощать план строительства по всей Руси сети крупных общежительных обителей, которые могли бы содействовать объединению под рукой Москвы разрозненных русских княжеств. В монастырях русские князья могли получить мудрое наставление и духовную поддержку, а в случае военных действий мощные монастырские стены могли обеспечить надежный тыл и оборону для княжеских дружин. Монастыри также служили средством оповещения о нашествии врагов и местом сбора вооруженных ополчений для отпора нашествий. Руководить строительством таких монастырей был поставлен Игумен земли Русской преподобный Сергий Радонежский, у которого уже был опыт создания крупных обителей. Само же строительство Сергий поручил своим лучшим ученикам. Строительство сети монастырей-крепостей обеспечило успешный ход подготовки к Куликовскому сражению.

По замечанию церковного историка Е. Е. Голубинского, «обстоятельства времени поставили свт. Алексия во главе государственного управления, так что он был митрополитом и в то же время первым государственным человеком, главою боярской думы своих князей». С восшествием в 1363 году на великокняжеский престол восьмилетнего отрока Димитрия Иоанновича, впоследствии нареченного Донским, будущего великого русского полководца и державостроителя, именно святитель Алексий, по завещанию, становится опекуном малолетнего правителя. Помогая ему наставлениями и советами собирать Русь и укреплять духовные силы народа, владыка, достигнул блестящих результатов, по сути своей предуготовив историческую победу русского воинства 8 сентября 1380 года на Куликовом поле и последующее освобождение Русской Земли от иноземного ига. При этом он оставался, прежде всего, архипастырем и в своей государственной деятельности пользовался только духовным оружием. Так, в 1365 году для разрешения спорного вопроса о княжеском наследовании нижегородской земли святителем Алексием в Нижний Новгород был послан игумен Радонежский Сергий. С благословения владыки, дабы избежать кровопролития и для вразумления князя Бориса, самовольно захватившего удел, прп. Сергий «затворил церкви» во всём городе, прекратив в них богослужение. Мера по тем временам чрезвычайная, располагающая боголюбивого русского человека к послушанию власти более, нежели демонстрация ею силы.