Распоряжением ФТС РФ от 12.07.2011 № 118-р утверждены «Методические рекомендации по проведению таможенного контроля решений, действий (бездействия) в области таможенного дела», в которых содержится перечень функциональных подразделений таможенных органов, наделенных полномочиями осуществления таможенного контроля, с учетом особенностей таковых. Полномочия по осуществлению таможенного контроля между уполномоченными функциональными подразделениями таможенных органов РФ разграничиваются по компетенции курируемых ими вопросов в области таможенного дела, а также с учетом характера оснований для осуществления таможенного контроля[11].
Принцип гласности. Если признания решения, действий (бездействия) нижестоящего таможенного органа признаются не соответствующими требованиям таможенного законодательства ЕАЭС, а также законодательства РФ о таможенном деле, то выносится решение об отмене (изменении) неправомерного решения, признании действия (бездействия) неправомерным, о чем уведомляется как нижестоящий таможенный орган, принявший неправомерное решение, так и участник внешнеэкономической деятельности (ВЭД) либо иное лицо, чьи законные интересы были затронуты таким решением, т. е. решением, вынесенным в порядке таможенного контроля.
Принцип всесторонности. Всесторонность при проведении таможенного контроля предполагает анализ полного комплекта документов, имеющих отношение к существу проводимого проверочного мероприятия. Так, если в ходе проверки выяснилось, что имеет место недостаточность документов и сведений, то должностное лицо, ответственное за осуществление таможенного контроля, подготавливает проект запроса о представлении необходимых документов и сведений в нижестоящий таможенный орган[12].
Принцип объективности. Должностное лицо, ответственное за осуществление таможенного контроля, должно непредвзято оценивать сведения, содержащиеся в представленных документах и сведениях.
Таким образом, таможенный контроль деятельности таможенных органов РФ является способом осуществления законности в области таможенного дела, основанным на принципах равенства лиц перед законом, единства системы таможенных органов и централизованного руководства, подконтрольности и подотчетности, ответственности, профессионализма и компетентности должностных лиц таможенных органов, гласности, всесторонности, а также объективности.