Помимо колхозов существовал сектор кооперативов, представлявших собой объединения потребителей. Кооперативы имели право создавать собственные сельскохозяйственные и промышленные предприятия, покупать продукцию госпредприятий, но при этом продавали товары преимущественно членам кооператива. До 1961 года существовал также артельный сектор, охватывающий мелкую и часть средней промышленности, часть сферы услуг, формирующийся как объединения работников артелей, аналогично колхозам. Артели не имели обязательства госпоставок, но имели право продавать продукцию государственным предприятиям и населению, а также покупать продукцию и машины на госпредприятиях. В 1961 году артели были преобразованы в госпредприятия.
Все эти секторы экономики подлежали планированию прямо или опосредованно. Частна торговля допускалась только мелкая, и планированию не подлежала по причине ничтожной доли в валовом производстве и торговом обороте.
Во-вторых, перед каждым планом ставились цели достижения определенной народно-хозяйственной задачи. В годы довоенных пятилеток такой задачей было создание развитой промышленности, и потому главное место в плане занимало развитие тяжелой промышленности. Исходя из этой задачи составлялись директивы, определявшие основные показатели плановых заданий на планируемый период.
В-третьих, поскольку народное хозяйство воспринималось как единая система, то основным методом планирования было составление балансов, натуральных и денежных. По каждому виду промышленной или сельскохозяйственной продукции, по основным видам потребительских товаров составлялся такой баланс, включавший оценку производства и потребления. Натуральные балансы составлялись в единицах измерений, принятых в той или иной отрасли. Баланс составлялся как отчетный, по достигнутому на определенную дату положению, так и плановый – желаемое состояние на конец планового периода. Разница между отчетным и плановым балансами являлась основой для определения плановых заданий. Вся планируемая продукция пересчитывалась в денежный эквивалент в соответствии с принятой системой цен (разрабатывались детальные прейскуранты на все виды продукции), и составлялся финансовый баланс, охватывающий всю экономику в целом. Финансовый баланс проверял правильность составления натуральных балансов и сводил их в единую систему. После проведения этой работы составлялась единая сводка натуральных и финансового баланса, которая и была собственно пятилетним планом.