В частности, в сентябре 1920 г. Наркомвнешторг обратился в НКВД с просьбой откомандировать из войск ВОХР бывших офицеров штаба Отдельного корпуса пограничной стражи: Н. Д. Желнина56, И. И. Крутикова57 и А. А. Загорского58, мотивируя это тем, что все они являются специалистами таможенного дела, а бывший полковник Н. Д. Желнин, перешедший в ВОХР из ГУПО, является еще и одним из организаторов пограничной охраны. Однако командующий войсками ВНУС В. С. Корнев 20 октября 1920 г. ответил на это отказом, мотивируя его тем, что в войсках и так ощущается недостаток кадров и, кроме того, уже разработан проект о передаче пограничной охраны в войска ВНУС. Тем не менее, 27 октября СТО вынес решение об откомандировании первых двух в Наркомвнешторг.59
В этот же период задачи войск ВОХР были значительны расширены: на них была возложена борьба с вооруженными контрреволюционными выступлениями, охрана путей сообщений (кроме прифронтовой полосы), важных государственных сооружений, предприятий и перевозимых грузов, изъятие излишков хлеба у «кулаков», борьба с «мешочничеством». Кроме того, войска ВОХР стали резервом РККА – только за второе полугодие 1919 г. из них в действующую армию было отправлено 95 батальонов общей численностью 52 700 человек, т.е. 52% численности личного состава войск и на 1 января 1920 г. численность войск ВОХР составила 105 000 человек.
Очередной этап реформирования специальных войск начался 1 сентября 1920 г. с принятием Постановления СТО, во исполнение которого караульная охрана, войска обороны железных дорог прифронтовой полосы (железнодорожной обороны) и транспортная (железнодорожная и водная) милиция были объединены с войсками ВОХР в войска внутренней службы (ВНУС).60 Высшим органом управления войсками по-прежнему был штаб войск, однако командующий войсками ВНУС, которым с 1 сентября 1920 г. по 19 января 1921 г. был член коллегии ВЧК и заместитель председателя Комитета обороны Москвы В. С. Корнев, теперь находился в одновременном подчинении и Наркома внутренних дел и Главкома Вооруженных сил. Была изменена и система управления войсками: сектора, территориально совпадавшие с округами, упразднены; в каждом округе введена должность командующего войсками ВНУС округа, а при командующих фронтами и армиями РККА введены должности командующих войсками ВНУС. Однако уже через два месяца, совместным приказом РВСР и НКВД от 1 ноября 1920 г. должность командующего войсками ВНУС округа была упразднена, а его функциональные обязанности переданы окружному военкому, как командующему войсками округа.