В Южной Германии должна была действовать 120-тысячная австрийская армия, а в Северной Италии – 100-тысячная австрийская армия. Наконец, на юге Италии в районе Неаполя должны были высадиться 25 тысяч русских и 5 тысяч английских солдат и, объединившись с неаполитанцами, действовать против южного фланга французской армии в Италии. Таким образом, предполагалось действие по четырём основным направлениям: в Северной Германии должно было собраться около 75 тысяч русских и шведов. В Южной Германии – 220 тысяч русских и австрийцев. В Северной Италии – 100 тысяч австрийцев, а в Южной Италии – 45 тысяч русских, англичан и неаполитанцев.
В дальнейшем, военные действия развивались следующим образом. Франко-испанский флот под командованием французского адмирала Вильнёва не смог прорвать английскую блокаду у мыса Финистерре, и отступил в Испанию, в порт Кадис, где был заблокирован. Адмирал Вильнёв, несмотря на плохое состояние флота, вышел, следуя указаниям Наполеона, в конце октября в море. 21 октября 1805 года у мыса Трафальгар франко-испанский флот принял бой с английской эскадрой адмирала Нельсона и был полностью разбит. В этом сражении Нельсон был смертельно ранен французским солдатом. Мушкетная пуля, выпущенная с расстояния 15 метров, пробила золотой эполет адмирала, прошла через плечо, раздробила позвоночник и пробила лёгкое, наполнив его кровью. Труп Нельсона поместили в бочку с бренди (крепкий алкогольный напиток) и доставили в Лондон, где 9 января 1806 года торжественно похоронили в соборе святого Павла.
После этого поражения французский флот так и не восстановился, уступив, таким образом, английскому флоту господство на море.
В начале осени 1805 года, Наполеон, получив сведения о перемещениях сил коалиции, вынужден был отложить высадку своих войск на Британские острова на неопределенный срок и двинуть войска в Германию. Тем временем 72-тысячная австрийская армия под командованием барона Карла Макка фон Лейбериха вторглась в Баварию, не дождавшись русских войск, ещё не достигших театра военных действий. Наполеон спешно покинул Булонский лагерь и, совершив марш-бросок на юг, в кратчайшие сроки достиг Баварии, где разбил австрийцев в битве под Ульмом. Оставшись в одиночестве, Кутузов вынужден был отступать с арьергардными боями (бой у Мерзбаха, бой при Холлабрунне) на соединение с ещё не подошедшей русской армией Буксгевдена.