Первый этап становления и развития налоговой системы РК (с 1 января 1992 года по 31 июнь 1995 года). Из-за отсутствия собственного опыта в основе создания налоговой системы Казахстан использован опыт соседних государств, и прежде всего в Российской Федерации. Практически Закон «О налоговой системе в Республике Казахстан», принятый 24 декабря 1991 года, являлся скопированным вариантом законодательства России. В результате в Казахстане была построена трехзвенная налоговая система, присущая федеративному государству. Она включала в себя три группы налогов:
1) общегосударственные;
2) общеобязательные местные налоги и сборы;
3) местные налоги и сборы.
Работа над совершенствованием налоговой системы Казахстана началась уже в 1992 году.
В истории развития налоговой системы Республики Казахстан определенное место занимает 1994 год. Именно в этом году были сделаны первые конкретные шаги на пути реформирования налоговой системы. Изменения коснулись двух крупных налогов: подоходного налога с физических лиц и налога на прибыль предприятий. Были приняты Указы Президента Республики Казахстан, имеющие силу закона «О налогообложении доходов физических лиц» и «О налогах на прибыль и доходы юридических лиц». С принятием указанных законодательных актов произошли радикальные изменения в механизме исчисления двух основных налогов.
Второй этап налоговой системы (с 01 июля 1995 года по 1998 год). В этот период количество налогов сократилось до 11. Они были подразделены на общегосударственные и местные налоги с внесенными изменениями и дополнениями. В основном этим требованиям отвечало принятие Указа Президента Республики Казахстан, имеющего силу Закона «О налогах и других обязательных платежах в бюджет» от 24 апреля 1995 г.
Третий этап налоговой реформы (с 1999 года по 2001 год). Основной задачей третьего этапа является усиление правовых аспектов взаимоотношений между государственными органами, имеющими отношение к бюджету, фискальными органами и налогоплательщиками. В целом, структура налогов, которая была заложена в 1995 году, достаточно оптимальна. На сегодняшний день существует 18 видов основных налогов, сборов и других обязательных платежей в бюджет, которые нужно совершенствовать и число которых также необходимо оптимизировать. Отсюда вытекает необходимость в реформировании налогового законодательства. То есть разработка налогового проекта Нового Налогового Кодекса. Он состоит из трех разделов: общая часть, особенная часть, налоговое администрирование.