По поводу происхождения янтаря он писал: «Говорят, что дерево румского ореха растет в реке, которая называется Ларинданос. Из этого дерева вытекает камедь; выделяясь, эта камедь тотчас сгущается в воде. Это то, что называется иликтрун, а некоторые люди называют его хусуфури, и это янтарь. Если его потереть, от него распространяется приятный запах, а цвет его такой, как цвет золота».
Позже в Европе тоже применяли лечение янтарем. Так, Камилло Леонардо, личный врач Чезаре Борджа, считал, что «янтарь при приеме внутрь способствует мочеиспусканию, облегчает менструации и деторождение. Он укрепляет расшатывающиеся зубы». Церковный реформатор Мартин Лютер верил, что янтарь защищает от образования камней в почках, и всегда носил в кармане кусок янтаря.
С помощью янтаря распознавали яды, лечили обмороки, слабоумие, удушье, назначали при кровавом поносе и сильном кашле, судорогах, простудах и болезнях зубов. Лечебное использование янтаря было настолько широким, а вера в его силу настолько крепкой, что многие лекари Средневековья включали его в состав эликсира бессмертия.
В Средние века и раннее Новое время ученые начали выдвигать другие теории. Например, в XVI веке немецкие ученые Г. Агрикола, А. Аурифабер и Г. Лудольф, голландский исследователь А. Кирхер, итальянский естествоиспытатель П. Бок кони и многие другие отстаивали неорганическое происхождение янтаря, утверждая, что он образуется из жидкого битуминозного вещества, содержащегося в недрах Земли и затвердевающего на воздухе.
У нас первым научные работы, в которых говорил в том числе о происхождении янтаря, написал Михаил Васильевич Ломоносов. Это были «Слово о рождении металлов от трясения земли» (1757) и «О слоях земных» (1761). Он поддерживал теории авторов античности о происхождении янтаря из смолы деревьев.
Сейчас картина образования янтаря в регионе Балтийского моря представляется так.
Примерно 50 миллионов лет назад на территории нынешней Швеции и части Балтийского моря располагалась суша. Первым этапом образования янтаря явилось обильное выделение смолы из хвойных деревьев, что связывают с резким потеплением климата в то время. Образование смолы также часто объясняют необходимостью защиты растения от повреждений и болезней, вызываемых насекомыми и грибками. Возможно, смола, выделяемая хвойными деревьями, обеспечивала защиту от жуков-короедов и других насекомых.