Государственное казначейство организует исполнение и исполняет центральный бюджет, а при наличии соответствующих соглашений – также местные бюджеты. Оно осуществляет операции со средствами бюджета, открывает и закрывает счета для зачисления и выдачи бюджетных средств в центральном банке и других уполномоченных кредитных организациях, ведет лицевые счета распорядителей средств и бюджетополучателей. Казначейство ведет сводный реестр главных распорядителей, распорядителей и получателей средств центрального бюджета, осуществляет регистрацию бюджетных учреждений, деятельность которых финансируется из бюджетных средств. При выявлении нарушений оно направляет распорядителям средств, бюджетополучателям и банковским учреждениям представления с требованием их устранения, обеспечивает контроль за выполнением этих требований. Казначейство обладает правом приостанавливать операции по лицевым счетам распорядителей и получателей бюджетных средств, взыскивать в бесспорном порядке средства, используемые не по целевому назначению. В пределах своей компетенции оно может налагать штрафы.
Исполнение центрального бюджета осуществляется органами казначейства на счетах, открытых для учета доходов и средств в центральном банке и его учреждениях (главных управлениях, расчетно-кассовых центрах). Право открытия и закрытия счетов центрального бюджета, определения их режима принадлежит государственному казначейству. Открывать или закрывать бюджетные счета без соответствующего разрешения нельзя. Основным принципом исполнения бюджета является принцип единства кассы. Он означает зачисление всех доходов и поступлений из источников финансирования дефицита бюджета на единый бюджетный счет и осуществление всех предусмотренных расходов с единого счета. Соблюдение данного принципа необходимо для обеспечения единства бюджетной системы, сглаживания неравномерности поступления доходов в бюджет как по времени, так и по территории.
Все операции и средства бюджета отражаются в системе балансовых счетов государственного казначейства. Осуществлять какие-либо операции с бюджетными средствами, минуя систему банковских счетов казначейства, запрещено. Казначейство несет ответственность за правильность исполнения центрального бюджета, ведение счетов и управление бюджетными средствами, полноту и своевременность зачисления средств на счета получателей. В сферу ответственности казначейства также входит финансирование расходов, не включенных в бюджетную роспись и утвержденных лимитов бюджетных обязательств.