Первоначально обитель состояла всего из нескольких келий и пещерной церкви. Но по ходатайству св. Саввы, ездившего в Константинополь, император Юстиниан оградил монастырь стенами и башней и одарил его многими приношениями. Потом около него начали селиться другие отшельники, искавшие спасения. Но вскоре им не стало хватать воды, и св. Савва начал усердно молиться Богу: «Господи Боже, если тебе угодно, чтобы место сие населилось во славу имени твоего, то благоволи даровать нам небольшое количество воды». Когда он так молился в тесной своей келье, то внизу, в долине, послышался стук. Посмотрев вниз, преподобный Савва увидел при свете луны онагра, который копытом копал землю, и когда уже довольно выкопал, то опустил в яму свою голову и стал пить. Святой тотчас пришел на это место, тоже немного покопал, и вскоре ему открылся источник чистой воды, что было неисповедимым благодеянием в этой безводной местности. С тех пор вода доставляла великое утешение братии, и хотя все черпали помногу, меньше ее не становилось[5].
В другую ночь вышел св. Савва из своей пещеры и, читая псалмы Давида, один пошел в долину. И вдруг над западным утесом, посреди соборной и пещерной церквей, увидел столп огненный, вершиной своей касающийся неба. Утром Савва пришел на это место и нашел большую и чу́дную пещеру, как будто самим промыслом Божьим уготованную для церкви. В восточной стороне ее находилось отделение со сводом, а в северной преподобный Савва обнаружил большую палату – наподобие той, в которой хранится церковная утварь; с южной стороны находился широкий вход. Святой, украсив пещеру, устроил в ней церковь в честь Благовещения и постановил собираться в ней в субботние и воскресные дни для богослужений.
Отовсюду стекавшиеся отшельники вскоре заселили не только монастырь, но и пещеры в соседних скалах. Когда число братий достигло 150 человек и около долины были возведены всякие хозяйственные постройки, завели в обители рабочий скот. Преподобный Савва сам заботился, чтобы инокам не было нужды посещать мир, который они покинули. А так как слава о богоугодной жизни св. Саввы разнеслась повсюду, то многие приходили и приносили все нужное. Во времена своего расцвета Лавра насчитывала до 5000 иноков.
Обитель эта была знаменита и прославлена святостью ее основателя и многих учеников его. Но некоторые иноки стали завидовать преподобному Савве. И тогда кроткий в обращении с людьми Савва удалился в Скифопольские страны, где и поселился в пустыне около реки Гадаринской. Сохранился и вертеп, в котором пребывал св. Савва до основания обители. В эту пещеру приходил на отдых лев.