Для содержания военнопленных на территории СССР и других государств, помимо 24 фронтовых приемно-пересыльных лагерей были сформированы и действовали 72 дивизионных и армейских, более 500 стационарных, 214 спецгоспиталей, 421 рабочий батальон, 322 лагеря органов репатриации военнопленных, интернированных и иностранных граждан.
За 1944–1945 годы были осуждены свыше 98 000 репатриантов. В следственных изоляторах тюрем содержалось еще свыше 1 866 тыс. бывших военнопленных и более 3,5 миллиона гражданских лиц.
Отказались вернуться в СССР свыше 450 000 человек, в том числе около 160 000 бывших военнопленных.
Всю эту работу подчиненные Абакумова осуществляли во взаимодействии с Управлением уполномоченного СНК СССР по делам репатриации и заграничных резидентур 1-го Управления (ПУ) НКГБ СССР и ГРУ Генерального штаба (ГШ). При этом основные усилия были направлены на выявление агентуры германских спецслужб и изобличение военных преступников.
Армейскими чекистами проводилась глубокая и всесторонняя проверка военнопленных с использованием в полном объеме всего арсенала оперативно-технических возможностей. Активно использовался институт агентуры и доверенных лиц. Прицельно и глубоко работали следственные работники.
В ходе проверки здесь подбиралась, обучалась и забрасывалась наша агентура в подразделения абвера и «Цепеллина», а также добывалась важная разведывательная информация.
Основная тяжесть этой работы легла на плечи сотрудников 2-го отдела ГУКР СМЕРШ НКО СССР. С июля 1943 года и до конца войны этот отдел возглавлял полковник Сергей Николаевич Карташов (1914<197>1979 гг.). С 1937 по 1941 – сотрудник Особого отдела ГУГБ НКВД СССР. С 1941 по 1943 гг. – заместитель начальника отделения 3-го Управления НКО, начальник отделения Управления особых отделов НКВД СССР.
С 1943 по 1946 г. – начальник 2-го отдела Главного управления контрразведки СМЕРШ, а с 1946 по 1949 г. – начальник 4-го отдела 3-го Главного управления МГБ СССР. В период с 1949 по 1950 г. – советник МГБ СССР при УГБ Венгерской народной республики. С 1951 по 1952 г. – заместитель начальника 1-го управления МГБ СССР. С 1953 по 1954 г. находился в резерве назначения 2-го Главного управления МВД СССР. В 1954 г. назначен начальником 7-го отдела 2-го Главного управления МВД СССР.