В результате розыскных и иных оперативно-следственных мероприятий, в комнате у Дмитрия и Натальи Бакшеевых были найдены замороженные куски мяса, происхождение которых устанавливается, остатки еды и части тел, вероятно, человеческих, хранящиеся в крутом растворе соли. Всё это было отправлено в лабораторию на экспертизу. На домовой территории и в подвальном помещении здания общежития найдены и изъяты части тела убитой Елены Вахрушевой, которые удалось опознать. Эти останки также отправлены экспертам. Изначально, уголовное дело в отношении Башкеевых возбудили по ч. 1 ст. 105 УК РФ (убийство), но позднее супругам было предъявлено несколько иное обвинение в убийстве, совершенном группой лиц по предварительному сговору (по части 2 статьи 105).
Уголовное дело передали в 1-й отдел, который занимается особо важными делами. Вадим Бугаенко, руководитель СУ СК России по Краснодарскому краю, 28 сентября рассказал прессе, что все фрагменты, найденные в комнате людоедов, принадлежат лишь одному человеку. Фотографии из телефона Башкеева Дмитрия, появившиеся в сети, породили невероятные и ужасающие слухи о семье-маньяков и серийных убийц-людоедов, промышлявших в Краснодаре. По этому факту была назначена и проведена процессуальная проверка.
Эта история быстро дополнилась невероятными слухами. Говорили, что Бакшеевы начали жить вместе и вести охоту на жителей города в далеком 1999 году. Жертв людоеды усыпляли, затем только убивали. Из мяса людей Бакшеевы готовили различные блюда, то, что оставалось, консервировали. По первоначальным данным, Наталья вроде бы продавала в училище некие консервы, вероятно, с человечиной. Позднее некоторые СМИ писали, что Бакшеевы были поставщиками подобных консервов другие заведения общественного питания Краснодарского края. Руководство края подобные сплетни категорически отвергли. Еще средства массовой информации сообщали о признании Дмитрия Бакшеева в убийстве, которое мужчина совершил в 2012 г. А Наталья, по сообщениям СМИ, якобы чистосердечно призналась в совершении 30-ти убийств. Но представители СК несколько раз делали заявления, что не имеют какими-либо информации об убийствах, которые были совершены каннибализм.
По заявлениям СК в деле Бакшеевых фигурирует лишь один эпизод по 1-му совершенному убийству. Однако слухи о семье каннибалов дают все новые подробности. Так, появилась информация о девятнадцати лоскутах человеческой кожи, якобы найденных при обыске дома Бакшеевых, а также об останках как минимум 7 тел, консервах с человеческим мясом, фото жутких блюд, например, из женских грудей, и даже кулинарные рецепты приготовления человеческого мяса.