После приезда отца Философа из Саровской обители в Петербург в его послужном списке появляется запись: «Удостоен Высочайшей благодарности Государя Императора за произнесенную в Высочайшем присутствии в Успенском соборе в Саровской пустыни 18 июля 1903 года проповедь» (66).
Несомненно, что на слова и поучения отца Философа отозвался и сам преподобный Серафим – вторая половина 1903 года была ознаменована для отца Философа многими радостными событиями.
Одно из них произошло в жизни Православного эстонского братства, товарищем Председателя которого был протоиерей Философ Орнатский, – 24 августа епископ Гдовский Константин, Председатель братства, при участии о. Иоанна Кронштадтского и отца Философа, освятил закладку каменного храма братства на Екатерингофском проспекте, 24. Первое пожертвование на строительство нового храма вновь сделал батюшка Иоанн Кронштадтский.
1 сентября 1903 года при Экспедиции Заготовления Государственных Бумаг была открыта Техническая Школа, в организации которой принимал деятельное участие о. Философ Орнатский как председатель Комиссии по составлению программ общеобразовательных предметов. Он же был назначен тогда штатным законоучителем Школы и, с разрешения Министра финансов, временно заведующим Технической Школой. Новое назначение несколько улучшило нелегкое материальное положение семьи Орнатских, так как батюшка при этом получил надбавку к своему жалованию по Экспедиции. И на этом поприще отец Философ показал себя деятельным и весьма полезным работником. Его удивительные организаторские способности и редкий педагогический талант буквально вдохнули жизнь в новое учреждение, ибо в новое дело, как и во все прочие дела, он вложил частицу своего сердца, частицу своей души…
«26 сентября 1903 года в зале Общества распространения религиозно-нравственного просвещения в духе Православной Церкви на Стремянной улице, под председательством Высокопреосвященнейшего Алексия, Экзарха Грузии и в присутствии Константина, епископа Гдовского, проходило общее собрание членов Общества, посвященное памяти преподобного Серафима Саровского чудотворца, привлекшее громадное количество слушателей, наполнивших помещение до тесноты.
Председатель Общества, протоиерей Философ Николаевич Орнатский поделился личными впечатлениями и духовной радостью, пережитыми в дни прославления и открытия мощей преподобного Серафима. Все, без сомнения, в свое время следили за этими всероссийскими торжествами по печатным известиям из Сарова, но послушать очевидца и участника этих торжеств было особенно интересно, а поэтому содержательнейшая речь была выслушана с напряженным вниманием.