Недостаток документальных материалов является серьезным препятствием на пути построения достоверной хронологии истории Древнего Египта. Но главная причина неудач египтологов в этом деле заключается в отсутствии надлежащей научной методики датировки событий древнеегипетской истории. Любая хронология древнеегипетской истории, когда-либо предлагавшаяся и предлагаемая в настоящее время в исторической литературе, носит, поэтому в значительной мере условный характер.
Сведения, приведенные в «Египтиаке» Манефона, перестали рассматриваться в современной египтологии в качестве основы для построения хронологии династической истории Древнего Египта. При определении дат пребывания у власти той или иной династии историки стараются ныне опираться на новые материалы, добытые в процессе археологических раскопок. Но эти материалы, как правило, дают основания для самых различных датировок правления одной и той, же династии.
Так И. Великовский указывал на наличие на внутренней стороне глазурованных плиток дворца Рамзеса III (в Tell-el-Yahudieh в Дельте) классических греческих букв 3 в.д.н.э. нанесенных в процессе изготовления. Фараон Псусенн 11 в.д.н.э. века построил здание на фундаменте, из-под которого извлечены слои, оставленные фараоном 8 в.д.н.э., который продолжал строительство, начатое фараоном 4 в.д.н. э. Эти факты не опровергнуты.
Надпись на острове Сехель близ Асуана утверждает, что она является копией документа, написанного Джосером на 18-ом году его правления. Эта копия, как в ней утверждается, была написана спустя 1000 лет после описанных в ней событий. Предполагается, что эта надпись была написана в течение 2 в.д.н. э. Часть надписи заявляет, что фараон Джосер после семилетнего голода пожертвовал богу Хнуму в Элефантине полосу земли выше первого порога. Подобная надпись на острове Филаи, содержит заявление жрецов бога Изиса, что Джосер сделал тот же самый подарок их богу для той же самой цели. Тогда 18 год правления Джосера шел в 12 в.д.н. э. Египтологами принято считать правление фараона 3 династии Джосера 2778—2723 г.д.н.э. или 2686—2613 г.д.н.э., Джосерти 2670—2663 г.д.н. э. Известны также правители 18 династии Джосеркара (1546—25 г.д.н.э.) и Джосерхеперура (1348—20 г.д.н.э.).
В настоящее время официально принята следующая хронология Древнего Египта: считается, что триста девяносто египетских монархов принадлежали к тридцати одной четко определяемой династии. Хотя «фараонами» называли себя правители и после 332 года до н.э. (до 251 г.н.э.), это были уже не урожденные египтяне, а македонские греки (период Птолемеев 332—30 г.д.н.э.) и римские императоры позднего времени (римский период 30 г.д.н.э. – 251 г.н.э).