В первоначальной редакции Принципы и Разъяснения противоречили политике Президента и Правительства РФ, направленной на стимулирование импортозамещения и экспорта готовой продукции, а также содержали необоснованные требования для бизнеса, которые не могут быть выполнены на практике, что влекло для предпринимателей высокие риски назначения оборотных штрафов, в том числе для компаний – экспортеров не сырьевых товаров. Действительно, получается, что немногочисленные пока экспортеры готовой продукции, сталкивающиеся с жесткой иностранной конкуренцией и вынужденные прибегать к агрессивной ценовой политике на внешних рынках, рисковали получить санкции от отечественного регулятора. Более того, не сырьевые экспортеры рисковали получить санкции из-за валютных колебаний, документы не учитывали специфику ценообразования на готовую продукцию (в т.ч. нецелесообразность или невозможность установить равную доходность на разных рынках), фактор масштаба (размещение производства на Дальнем Востоке требует экспорта в соседние страны вследствие узости локального рынка).
В результате, в ноябре 2015 г. в Принципы и Разъяснения были внесены изменения. Применение документов к не сырьевым товарам исключено, они применяются только к экспорту сырья и полуфабрикатов.