В соответствии со ст. 4 Закона АР от 7 декабря 1999 г. № 767-IQ «О прокуратуре»[37], прокуратура в предусмотренных законом случаях и порядке: возбуждает уголовное дело и ведет предварительное следствие, а также осуществляет оперативно-розыскную деятельность с целью обеспечения возбуждения уголовного дела или ведения следствия по преступлениям, связанным с коррупцией; осуществляет процессуальное руководство предварительным расследованием по уголовному делу и обеспечивает соблюдение законов; осуществляет контроль за исполнением и применением законов в деятельности органов дознания и оперативно-розыскных органов; возбуждает в суде иск (подает заявление), принимает участие в качестве истца при рассмотрении дел по гражданским и экономическим спорам; принимает участие в качестве стороны при рассмотрении в суде уголовных дел, защищает государственное обвинение; подает протест против решений суда; принимает участие в достижении цели назначенных судами наказаний[38]. Однако среди стран СНГ только в Азербайджане прокуратура не осуществляет в полном объеме надзор за деятельностью пенитенциарных учреждений[39]. В порядке и случаях, установленных законом, на основании решения суда допускается осуществление прокуратурой процессуальных действий, ограничивающих права и свободы человека и гражданина, предусмотренные Конституцией АР.
На органы прокуратуры возложены дополнительно еще две функции: правотворческая функция и функция надзора за исполнением и применением закона в отношении депутатов Милли Меджлиса и премьер-министра АР, обладающих неприкосновенностью. Согласно ст. 90 и 123 Конституции АР, они могут быть задержаны только в случае, если застигнуты на месте совершения преступления и лишиться своей неприкосновенности на основании представления Генерального прокурора АР.
В первоначальной редакции Конституции АР не было положения о праве законодательной инициативы Прокуратуры АР. С 24 августа 2002 г. всенародным голосованием в ст. 96 Конституции АР были внесены изменения, наделяющие Прокуратуру АР правом вносить на обсуждение Милли Меджлиса АР законопроекты и иные вопросы. Сторонники наделения прокуратуры этим полномочием исходили из того, что прокуратура обладает информацией о состоянии законодательства и практики его применения, что позволяет осуществлять подготовку предложений по совершенствованию законодательства. Однако это право пока не было реализовано.