Основная организационно-штатная и боевая единица сил специальных операций – оперативный отряд. В составе оперативного отряда предусматривается иметь исполнителей (группы исполнителей), способных решать специальные боевые задачи с использованием присущих только им приемов и способов: разведчики-диверсанты; диверсанты-боевики; диверсанты-идеологи, в том числе специалисты по боевым действиям и разведке, вооружению, минно-подрывному и инженерному делу, медицине, радио, снабжению, ведению допросов, пропаганды и агентурной работы, по связям с местным населением, подготовке иррегулярных войск и т. п.
Классификация оперативных отрядов: глубинной разведки; диверсионно-штурмовые; десантно-штурмовые; специального назначения; разведывательно-диверсионные отряды боевых пловцов; мобильные отряды психологического воздействия; мобильные отряды административного воздействия; разведывательно-диверсионные отряды для контрборьбы с РДО противника; разведывательно-диверсионные отряды для контрборьбы с РДО боевых пловцов противника; десантно-штурмовые отряды морской пехоты и другие.
Отряд глубинной разведки – воинское формирование от пяти до десяти человек, предназначенное для ведения разведки в тылу противника на глубину до 450 км.
Диверсионно-штурмовой отряд – воинское формирование численностью до 30 человек, предназначенное для осуществления диверсий в глубоком тылу противника.
Оба типа отрядов развертываются в боевой порядок за несколько суток до начала активных боевых действий.
Десантно-штурмовые отряды создаются на базе частей ВДВ и морской пехоты, предназначаются для уничтожения крупных стационарных объектов противника, захвата коммуникаций, рубежей, районов.
Отряды специального назначения – наиболее подготовленные для действий в тылу противника формирования, способные выполнять различные разведывательные, диверсионные и подрывные задачи, привлекая для этих целей агентуру, используя методы как партизанского, так и повстанческого движения. Типовая численность отряда – 12 человек под командованием лейтенанта. Имеют на вооружении специальные средства борьбы, в частности наркотические и психотропные препараты, пластичные взрывчатые вещества повышенной мощности, переносные ракетные установки.