Государственная религиоведческая экспертиза назначается в случае необходимости дополнительных исследований для:
подтверждения религиозного характера организации и определения или отсутствия установленных законодательством оснований отказа в ее регистрации в качестве религиозной организации с соответствующим наименованием;
выявления в особенностях вероучения и практики религиозного объединения наличия или отсутствия связи с действиями, совершенными участниками религиозного объединения, признанными в установленном порядке противоправными, для обращения в суд с иском о запрете деятельности религиозного объединения и ликвидации религиозной организации;
выявления необходимости приостановления деятельности религиозного объединения, в том числе в связи с проведением экстремистской деятельности.
Перечень задач при проведении государственной религиоведческой экспертизы определен с учетом потребностей правоприменительной практики в государственном регулировании миссионерской деятельности, ограничения деятельности организаций, проводящих религиозную деятельность, но зарегистрированных в качестве общественных, и в контексте противодействия экстремистской деятельности.
Однако в связи с тем, что сегодня отсутствует единое юридическое понимание определения религии, эксперты фактически руководствуются собственными представлениями о религии.[37]
На основании принятого решения о государственной регистрации религиозной организации уполномоченный регистрирующий орган в срок не более чем 5 рабочих дней со дня получения необходимых сведений вносит в ЕГРЮЛ соответствующую запись и сообщает об этом в орган, принявший решение о государственной регистрации религиозной организации.
Федеральный орган государственной регистрации или его территориальный орган не позднее 3 рабочих дней со дня получения информации о внесенной в ЕГРЮЛ записи о религиозной организации выдает заявителю документ, подтверждающий факт внесения записи о религиозной организации в ЕГРЮЛ. Форма свидетельства о государственной регистрации некоммерческой организации, в том числе религиозной организации, утверждена приказом Министерства юстиции РФ от 5 марта 2006 г. №150.[38]
Единый государственный реестр юридических лиц ведется Министерством РФ по налогам и сборам и его территориальными органами.