Наиболее ценными веществами в ромашке аптечной являются хамазулен и матрицин. Чтобы извлечь их из сырья, соцветия нужно обработать определенным способом, например приготовив отвар или настой.
Ромашка аптечная далеко не всегда применяется в чистом виде, ее лечебные свойства усиливают другие растения, поэтому и официальная, и народная медицина рекомендуют употреблять ее в составе травяных сборов.
Для лечения различных заболеваний используются разные формы препаратов из ромашки. Настой применяется как кровоостанавливающее, мочегонное, противосудорожное, желчегонное, потогонное, успокаивающее и противовоспалительное средство. Лечебные ванны и клизмы, приготовленные из травяных сборов с ромашкой, оказывают антисептическое, противовоспалительное и вяжущее действие. Отвар употребляют при болях в суставах, ушибах, неврозах, судорогах, невралгии тройничного нерва. Полоскания полезны при воспалительных заболеваниях верхних дыхательных путей, а примочками лечат угри, свищи, сильный зуд.