В связи со строительством железной дороги Киев – Балта в 1865 была основана Жмеринка, как большая узловая станция Правобережья. Станция располагалась между селами Малая и Большая Жмеринка на месте вырубленного дубового первобытного леса. Движение поездов по железной дороге Одесса – Жмеринка – Киев начался 8 июня 1870 года, по железной дороге Жмеринка-Волочиск – в сентябре 1871 года, по железной дороге Жмеринка-Могилев-Подольский – 30 сентября 1892 года. Жмеринский вокзал построен на переходе от XIX к ХХ столетию. Он внесен в 1999 году в реестр государственных архитектурных памяток национального достояния.
«При станции Жмеринка образовался поселок, частью составляющий железнодорожную колонию, а частью – вызванный к жизни спросом на разного рода услуги» со стороны железнодорожного персонала. Само местечко Жмеринка находится в двух верстах от станции и носит название Малой Жмеринки» – читаем в книге П.Н.Андреева «Иллюстрированный путеводитель по Юго-Западным казенным железным дорогам» – Киев. – 1899 г.
Статус города Жмеринка получила 18 ноября 1903 года. В 1904 году были определены его границы, а с 7 января 1905 начало действовать городское управление. Первым городским старостой был избран дворянин Карл Викентьевич Вронский. Свое название Жмеринка получила от сел расположенных по обе стороны от железнодорожного пути – Большая и Малая Жмеринка. Что же к происхождению самого названия, то существуют разные версии. Одни исследователи считают, что оно происходит от польского выражения «жму руку», сказанному при встрече двух победителей. Другие усматривают ее в том, что на территории современного города было поселение, в котором жилы гончары, которые с глины изготовляли разную посуду – «жали рынки». Еще есть гипотеза, которая утверждает, что «джемери» – это густой темный лес, чащи, на месте которого возникли эти поселения.
Но наиболее вероятной есть следующая версия. Древнегреческий историк Геродот свидетельствует, что подольская земля была известная миру еще за пять веков до нашей эры. Он упоминает алозонов и невров, которые заселяли эти земли. С его работ мы узнаем, что юг Украины в те далекие времена населяли киммерийцы, которых ассирийцы называли «GIMMIR» (или «ГИММИР»). В украинском языке (как и в других славянских языках) звук «ж» чередуется со звуком «г». Возможно, отсюда и пошло название поселений наших далеких предков. Оно сохранилась в названиях подольских поселений Чемеринцы, Чемер, Чемерисы, в названии травы чемерицы, одежды-чемерки, а, возможно, со временем в названии поселения – Жмеринка.