По выполняемым функциям все федеральные органы исполнительной власти в области обращения с радиоактивными отходами подразделяются на две группы.
В первую группу входят органы, осуществляющие управление в области обращения с радиоактивными отходами: Министерство обороны Российской Федерации; Федеральное агентство по промышленности; Федеральное агентство по техническому регулированию и метрологии; Федеральное агентство морского и речного транспорта; Федеральное агентство по науке; Федеральное агентство по здравоохранению и социальному развитию; Федеральное агентство по недропользованию.
К их основным полномочиям отнесены организация государственного учета, контроля и физической защиты пунктов хранения и захоронения радиоактивных отходов, осуществление полномочий собственника в отношении объектов использования атомной энергии, организация готовности в случае радиационной аварии и т. п.
Вторую группу составляют органы по регулированию безопасности в области обращения с радиоактивными отходами, к числу которых относятся: Министерство Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий; Федеральная служба по экологическому, технологическому и атомному надзору; Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; Федеральное медико-биологическое агентство. Они выполняют надзорные, разрешительные функции (выдают лицензии, заключения), проводят экспертизы, инспекции и т. п., а также применяют санкции к правонарушителям за несоблюдение законодательства в области обращения с радиоактивными отходами.
Статья 7. Полномочия органов государственной власти субъектов Российской Федерации, полномочия органов местного самоуправления в области обращения с радиоактивными отходами
1. Органы государственной власти субъектов Российской Федерации осуществляют следующие полномочия в области обращения с радиоактивными отходами:
1) согласование решений о размещении и сооружении на территории соответствующего субъекта Российской Федерации пунктов хранения радиоактивных отходов в порядке, установленном Градостроительным кодексом Российской Федерации и Федеральным законом от 21 ноября 1995 года № 170-ФЗ «Об использовании атомной энергии»;
2) иные полномочия в области обращения с радиоактивными отходами в порядке, установленном законодательством Российской Федерации.