Целый ряд наказаний исполняется учреждениями уголовно-исполнительной системы Федеральной службы исполнения наказаний. К их числу относятся:
1) уголовно-исполнительные инспекции, исполняющие наказания в виде лишения права занимать определенные должности или заниматься определенной деятельностью, обязательных работ, исправительных работ; кроме того, они осуществляют контроль над условно осужденными и женщинами, которым предоставлена отсрочка отбывания наказания; на эти инспекции возложено направление к месту отбывания наказания лиц, осужденных к ограничению свободы, хотя эта функция ими не исполняется, поскольку ограничение свободы еще не введено в действие. Всего на учете в 2 443 уголовно-исполнительных инспекциях на 1 января 2007 г. состоял на учете 574 441 человек;
2) исправительные центры, которые должны исполнять наказание в виде ограничения свободы (данное наказание еще не введено в действие);
3) арестные дома, которые должны исполнять наказание в виде ареста (данное наказание еще не введено в действие);
4) исправительные учреждения, исполняющие наказание в виде лишения свободы, – колонии-поселения, исправительные колонии общего, строгого, особого режима, тюрьмы, воспитательные колонии; больные осужденные помещаются в лечебные исправительные учреждения; наказания в отношении осужденных, оставленных с их согласия для хозяйственного обслуживания в следственном изоляторе, исполняются этим учреждением.
В уголовно-исполнительной системе 166 колоний-поселений (в которых на 1 января 2007 г. отбывали наказание 56 559 человек), 208 исправительных колоний общего режима (230 849 человек), 248 колоний строгого режима (332 859 человек), 30 колоний особого режима (9961 человек). В уголовно-исполнительную систему входят также 62 воспитательные колонии, в которых содержалось 21 872 несовершеннолетних и лиц, не достигших возраста 21 года. В соответствии с Законом от 9 марта 2001 г. воспитательные колонии не имеют видов режима;
5) колонии особого режима для лиц, отбывающих пожизненное лишение свободы, исполняют это наказание; в этих же колониях отбывают наказание осужденные к смертной казни, помилованные Президентом России; всего имеется пять колоний особого режима для содержания отбывающих пожизненное лишение свободы (на 1 января 2007 г. в них содержались 1628 человек);