Епископ Афанасий был арестован 18 апреля. В свое время он был студентом владыки Феодора в Московской Духовной Академии, в которой обучался с 1908-го по 1912 г., в том числе при ректорстве владыки Феодора с 1909 г. Более того, был пострижеником епископа Феодора, а духовным отцом его при постриге стал архимандрит Симеон (Холмогоров). После того как иеромонах Афанасий стал преподавателем сначала Полтавской, а потом Владимирской Духовных Семинарий, пути их с владыкой Феодором несколько разошлись, но после революции епископ Афанасий придерживался тех же взглядов на церковную политику, что и владыка Феодор, и хотя со временем владыка Афанасий больше сблизился как с духовным руководителем с митрополитом Кириллом (Смирновым), но и связь с владыкой Феодором не прерывалась, и, так как оба владыки постоянно были то в тюрьме, то в ссылке далеко друг от друга, эта связь чаще, видимо, поддерживалась через архимандрита Симеона. Об этом не раз говорится и в деле владыки Афанасия, и в делах владыки Феодора и архимандрита Симеона.
Уже в постановлении об избрании меры пресечения от 1 мая 1936 г. следователь Новиков, «нач. 3 отд. Секретно-политич. УГБ Управления НКВД по ИПО» (Ивановская промышленная область. – Ред.), пишет, что Сахаров изобличается в том, что «является вдохновителем и организатором нелегального к/р (контрреволюционного) церковно-канонического центра "ИПЦ" (Истинно Православной Церкви), ставящего задачу активной борьбы против Советской власти» (дело № П-8218, том 1, лист 74).
Епископ Афанасий (Сахаров). Фотография из следственного дела 1943 г.
А 15 мая 1936 г. в постановлении о продлении срока содержания под стражей сказано, что Сахаров уже «достаточно изобличен» в том, что «являлся активным участником нелегального контрреволюционного центра, проводившего антисоветскую деятельность на основе к/р платформы так называемого "ссыльного епископата", ориентированного на получение помощи в борьбе против Советской власти – белоэмигрантской "церкви" и Ватикана. Нелегальным центром в широких размерах создавались антисоветские кадры церковников, насаждались тайные "церкви", к/р группы "ИПЦ", устраивались антисоветские сборища, устанавливались связи с контрреволюционным националистическим и белогвардейским элементом на Украине». (Л. 75.)