Новосибирский автовокзал расположен в центре города. Автотрассы из Новосибирска идут в шести направлениях. На Омск идет Федеральная трасса М51, на Колывань и Юргу – Федеральная трасса «Байкал» М53, на Ленинск-Кузнецкий и Барнаул – Чуйский тракт М52 и Камень на Оби. В городе и окрестностях имеется три автомобильных моста через Обь (мост Северного обхода между п. Мочище и Красный яр, Димитровский и Октябрьский). Автомобильный проезд возможен также и через плотину ОбьГЭС. При следовании транзитом с запада на восток Новосибирск можно объехать по самому северному из мостов. В черте города расположены два автомобильных моста через реку Иня.
В Новосибирске находится управление Западно-Сибирского речного пароходства. Пересечение водных путей стало дополнительным фактором роста города. Речной порт Новосибирска находится неподалеку от знаменитого моста через Обь в Центральном районе города. Навигация на Оби состоит из перевозки транзитных грузов на дальние расстояния, местных пассажирских перевозок и добычи песка. Туристические речные маршруты существуют до Томска и по Обскому морю до Завьялово.
В Новосибирске имеется два аэропорта: Толмачево (имеет международный статус), Северный (городской) и аэродром Ельцовка.
История. Новосибирск возник в 1893 году как Новая Деревня (неофициальное название – Гусевка) в связи с постройкой железнодорожного моста через реку Обь, при проведении Транссибирской магистрали. Неподалеку от развалин старой крепости, рядом с устьем речки Каменки вырос рабочий поселок. В 1894 году Новая Деревня была переименованная в поселок Александровский, в 1895 году – в поселок Ново-Николаевский, преобразованный в 1903 году в Ново-Николаевск Томской губернии.
В 1912 году власти Ново-Николаевска ввели всеобщее начальное образование, которое в России в то время было введено только в Ярославле. Через три года в Санкт-Петербурге по настоянию городского головы Ново-Николаевска было принято решение прокладывать от станционного городка железную дорогу на Семипалатинск, что очень быстро превратило Ново-Николаевск в крупный железнодорожный узел. С постройкой железной дороги Ново-Николаевск начал быстро развиваться. В 1915 году, когда строительство железной дороги Ново-Николаевска, подходило к концу, в городе насчитывалось 70 тысяч населения и работало 7 банков.