Подпунктом 14 п. 3 ст. 346.12 НК РФ установлено ограничение применения УСН для организаций, в которых доля непосредственного участия других организаций составляет более 25 %.
В соответствии с подп. 17 п. 3 ст. 346.12 НК РФ, Законом от 21 июля 2005 г. № 101-ФЗ бюджетные учреждения не могут применять упрощенную систему налогообложения.
По мнению ВАС РФ, изложенному в решении от 19 ноября 2003 г. № 12358/03, положения подп. 14 п. 3 ст. 346.12 НК РФ не распространяются на унитарные предприятия, поскольку их имущество не распределяется по вкладам (долям, паям). Поэтому указанные предприятия могут применять УСН.
Законодательно норма, разрешающая некоммерческим организациям применять УСН, предусмотрена Федеральным законом от 21 июля 2005 г. № 101-ФЗ: «некоммерческие организации, в том числе организации потребительской кооперации, осуществляющие свою деятельность в соответствии с Законом РФ от 19 июня 1992 г. № 3085-1 «О потребительской кооперации (потребительских обществах, их союзах) в Российской Федерации», а также хозяйственные общества, единственными учредителями которых являются потребительские общества и их союзы, осуществляющие свою деятельность в соответствии с указанным Законом».
Согласно подп. 15 п. 3 ст. 346.12 НК РФ не вправе применять УСН организации и индивидуальные предприниматели, средняя численность работников которых за налоговый (отчетный) период, определяемая в порядке, устанавливаемом Росстатом, превышает 100 человек.
В соответствии с п. 4 ст. 346.12 НК РФ в случае превышения численности работников организации обязаны осуществить переход на общий режим налогообложения. Эта норма введена Федеральным законом от 21 июля 2005 г. № 101-ФЗ.
Средняя численность работников определяется в соответствии с Указаниями по заполнению форм федерального статистического наблюдения:
• № П-1 «Сведения о производстве и отгрузке товаров и услуг», утвержденной приказом Росстата от 14 октября 2009 г. № 226;
• № П-2 «Сведения об инвестициях», утвержденной приказом Росстата от 10 июля 2009 г. № 132;
• № П-3 «Сведения о финансовом состоянии организации», утвержденной приказом Росстата от 16 июля 2009 г. № 139;
• № П-4 «Сведения о численности, заработной плате и движении работников», утвержденной Приказом Росстата от 26 августа
2009 г. № 184,