В случае возникновения сомнений относительно признания места деятельности организации, территориально обособленного от местонахождения организации, обособленным подразделением для решения вопроса о постановке на учет в налоговых органах, рекомендуется обращаться в налоговый орган по местонахождению организации.
Налоговые агенты – российские организации, имеющие обособленные подразделения, обязаны перечислять исчисленные и удержанные суммы налога как по своему местонахождению, так и по местонахождению каждого своего обособленного подразделения (п. 7 ст. 226 НК РФ).
Сумма налога, подлежащая уплате в бюджет по местонахождению обособленного подразделения, определяется исходя из суммы дохода, подлежащего налогообложению, начисляемого и выплачиваемого работникам этих обособленных подразделений.
Таким образом, головная организация обязана вести учет доходов, полученных от нее физическими лицами, отдельно по головной организации и отдельно по обособленному подразделению. Кроме того, головная организация должна уплачивать исчисленные и удержанные суммы НДФЛ как по своему местонахождению, так и по местонахождению обособленных подразделений. При этом она обязана оформлять отдельные платежные поручения по каждому обособленному подразделению с указанием присвоенного ему при постановке на налоговый учет КПП и соответствующего кода ОКАТО муниципального образования, в бюджет которого перечисляется НДФЛ (письмо УФНС РФ по городу Москве от 24 января 2008 г. № 28–11/006047).
Если сотрудник организации в течение 1 месяца работает в нескольких обособленных подразделениях, то в соответствии с письмом Минфина РФ от 24 января 2008 г. № 03-04-06-01/16 НДФЛ с доходов такого сотрудника должен перечисляться в соответствующие бюджеты по местонахождению каждого такого обособленного подразделения с учетом отработанного времени в каждом обособленном подразделении.
В письме ФНС РФ от 13 марта 2006 г. № 04-1-03/132 «О налогообложении доходовфизических лиц» отмечено, что если обособленные подразделения не имеют отдельного баланса и расчетного счета, то с доходов работников обособленных подразделений удержание НДФЛ должна осуществлять головная организация, перечисление осуществляется по местонахождению этих обособленных подразделений.
В случае если обособленное подразделение зарегистрировано в середине месяца, то НДФЛ уплачивается в бюджет по месту учета обособленного подразделения пропорционально доле дохода, начисленного за время работы в таком обособленном подразделении (письмо УФНС РФ по городу Москве от 26 декабря 2007 г. № 28–11/124267).