В своем оперном творчестве Коваржовиц следовал традициям Сметаны. К наиболее известным произведениям Коваржовица относятся оперы «Псоглавцы» по А. Ирасеку (1898) и «На старой белильне» по повести Б. Немцовой (1900), многие страницы которых отличаются подкупающей мелодичностью, искренним чувством. В начале 1900-х гг. Коваржовиц прекратил свою композиторскую деятельность. Ряд произведений Коваржовица издан под псевдонимом Ш. Форжерон.
Оперы (кроме упомянутых): «Женихи» (1884), «Через окно» (1886), «Ночь Симона и Иуды» (по произведению «Треуголка» П.А.Аларкона, 1892, позднее исполнялась под названием «Фраскита»), «Царь Эдип» (1894; опера-фарс), «Клятва» (не окончена; пролог к опере был исполнен в 1921 г.).
Опера в 3-х д. (6 к.), либретто К. Шипека по одноименному роману А. Йирасека. Премьера: Прага, 24 апреля 1898 г.
Образное и идейное содержание романа, рисующего борьбу крестьян-ходов (этническая группа на юго-западе Чехии) с феодалами в XVII в., несколько пострадало при пересадке на оперную почву: в угоду традиции изображение освободительной борьбы ослаблено. В центре оперы – образ крестьянина Яна Козины, хранителя старинных грамот, определявших вольность и права ходов. Насилием, с помощью оружия, грамоты отняты. Уничтожены последние остатки свобод, но Козина не смиряется, он отказывается признать власть немца Ламингера и, не сломленный пытками, идет на казнь, грозя судьям и палачам вечным судом. Год спустя угнетатель ходов, присвоивший их земли, умирает – возмездие свершилось.
Музыка оперы, следующая традиции Сметаны, носит народный характер. Широкую популярность получила песня «Зеленые леса».