В 1932 г. вступил в Национал-социалистический союз учителей и Союз борьбы за германскую культуру, организованный Альфредом Розенбергом. В мае 1933 г. вступил в австрийскую НСДАП (автоматически выбыл из неё после её запрета). Был близок к Отечественному фронту, стал его членом в октябре 1935 г. В феврале 1933 г. назначен директором Австрийского Института ориенталистики.
В 1934 г. по политическим причинам был времено отсранён от работы. После убийства канцлера Энгельберта Дольфуса против Христиана было начато дисциплинарное преследование.
В это же время ему начали поступать предложения заняться научной работой в Германии, которое прекращается только в начале 1936 г. В марте-июле 1935 г. находился в исследовательской поездке в Палестине, Сирии и Ираке, где изучал древние гробницы и музейные экспозиции. В марте 1936 г. возобновил работу на прежних должностях.
Карьера при нацистах
После аншлюсса 1938 г. карьера Христиана пошла в гору. В этом же году он вступает в НСДАП и становится директором Института славянской филологии и славянских древностей в Вене, а также директором Института этнографии. В 1938—1943 гг. занимал пост декана философского факультета, в 1943—1945 гг. – проректора Венского университета.
С 1 апреля 1939 г. глава учебно-исследовательского отдела Ближнего Востока Аненербе.
В сентябре 1939 г. вошёл в Личный штаб рейхсфюрера СС.
В годы Второй мировой войны совершал исследовательские поездки в Болгарию и Сербию.
10 апреля 1945 г., за три дня до взятия Вены советскими войсками, назначен ректором Венского университета (смещён заочно через 2 месяца).
После войны
22 мая 1945 г. был арестован американцами по обвинению в сотрудничестве с нацистами, лишён всех занимаемых должностей и интернирован.
В лагере вёл преподавательскую работу, сотрудничал с американскими оккупационными властями.
В сентябре 1947 г. был освобождён, в апреле 1948 г. восстановлен в правах. На пенсии (920 шиллингов к 1952 г.) продолжал заниматься исследовательской работой, причем Христиану был учтён стаж 1938—1945 гг. С 1956 г. почётный член Антропологического общества в Вене.
По поводу деятельности Христиана существовали противоположные мнения: участник Сопротивления Карл Шуберт называл его «нацист-убийца» после войны о Христиане сложилось мнение как о жертве обстоятельств.