Однако в 1880-е годы рост сахарной промышленности замедлил экономический кризис. Сначала он охватил те районы страны, которые потерпели от неурожая, а после краха Московского коммерческого банка сказался и на состоянии отрасли в Украине. Покупательский спрос на сахар быстро упал, а вслед за ним – и цена на него. Ажиотажем и спекуляциями в сахарном производстве воспользовались собственники железной дороги, которые тут же подняли стоимость железнодорожных перевозок. Все это привело к значительному снижению производства сладкой продукции. С целью скорейшего преодоления кризиса сахарозаводчики добились согласия правительства на вывоз сахара за границу на льготных условиях. За счет этого даже в условиях кризиса они получали большие прибыли.
Однако вместе с развитием сахарной промышленности стал расти и акциз на сахар – прибыль царской казны. Но этот высокий налог платили не предприниматели, а население, так как сахарозаводчики вкладывали его в себестоимость и тем повышали цену продукции. В 1877 году цены на сахар выросли с 3 руб. 50 коп. до 7 руб. 50 коп. за пуд. Прибыльность сахарного бизнеса вызвала небывалый рост производства сахара. В результате рынок был перенасыщен им. В этих условиях сами сахарозаводчики обратились к правительству с просьбой в законодательном порядке сократить размеры производства отрасли. Понимая, что сахарный рынок находится в шатком положении, самые крупные из них, в том числе и И. Г. Харитоненко, выступили в 1887 году с инициативой создания сахарного синдиката, который бы регулировал рост промышленности, цены и объемы продукции, вывозимой за границу. По договоренности членов синдиката они были обязаны вывозить часть сахара за границу, но этот вывоз прекращался, как только цена на него падала до 4 руб. 50 коп. за пуд. За неисполнение договора, за каждый пуд не вывезенного сахара платилась неустойка в течение восьми недель. Так частные предприниматели пришли к необходимости обязательного регулирования «сахарной политики» в масштабах не только собственных экономий, но и государства в целом. Это во многом оздоровило положение на сахарном рынке. Но уже спустя 4 года после смерти Ивана Герасимовича Харитоненко многие сахарозаводчики стали уклоняться от обязательного вывоза сахара, и государство снова взяло в свои руки установление норм его производства для внутреннего рынка и норм производства на каждом заводе. И Павел Иванович Харитоненко, наследник одной из самых больших в Украине «сахарных держав», едва приняв на себя бразды управления, оказался лицом к лицу с государственной монополией. Но, несмотря на молодость и отсутствие опыта самостоятельного управления крупной фирмой, он сумел выйти победителем как из противостояния с государственным аппаратом, так и в жесткой борьбе с такими сильными конкурентами на сахарном рынке, как Терещенко, Яхненко-Симиренко, Бродские и Хряковы.