Через год после подписания Трактата «О торговле и границах» русское правительство поставило своей целью присоединить весь остров Сахалин к территории России. В этих целях право управления Сахалином (Карафуто), которое до того находилось в руках Российско-Американской компании, было передано Сибирскому генерал-губернаторству. Это происходило на фоне неблагоприятной международной обстановки, когда Россия, потерпев поражение в Крымской войне (1853–1856) и отказавшись от своих корыстных стремлений захватить проливы Босфор и Дарданеллы, оказалась перед необходимостью требовать выхода к Дальнему Востоку. Вынудив Китай уступить в 1858 г. по Айгуньскому мирному договору левый берег реки Амур, а два года спустя по Пекинскому договору – восточный берег реки Уссури, Россия в 1862 г. в качестве опорного пункта для продвижения в Азию и акваторию Тихого океана построила город Владивосток.
В 1859 г. адмирал Николай Николаевич Муравьев-Амурский, прибыл в г. Канагава во главе эскадры из семи кораблей и потребовал передать во владение России весь остров Сахалин. Получив отказ Японии, правительство России со своей стороны, прилагая все силы для колонизации Сахалина, фактически ставит его под свое управление. В результате такой политики между проживавшим на острове японским и российским населением стали возникать конфликты. По прошествии пятнадцати лет новое правительство во главе с императором Мэйдзи, оказавшись перед проблемой неизбежной русификации всего острова Сахалин, провело переговоры с правительством России и в 1875 г. заключило договор об обмене Сахалина на Курильские острова. Исходя из содержания этого договора, японское правительство, отказалось от права на совместное владение островом Сахалин и признало полный владение России всем этим островом. В качестве компенсации Россия уступила Японии Курильские острова, а именно 18 островов, простирающихся от острова Шумшу до острова Уруп.
Данная граница между Японией и Россией оставалась неизменной вплоть до Портсмутского договора, который был заключен в результате Русско-японской Войны 1904–1905 гг.
«Япония во время русско-японской войны развязала агрессию против нашей страны, воспользовавшись слабостью царского правительства. Япония в феврале 1904 г., когда переговоры между Россией и Японией еще продолжались, неожиданно и вероломно, без объявления войны напала на нашу страну и атаковала русскую эскадру в районе Порт-Артура» (