В 1 в. до н.э. нынешнюю территорию Боснии и Герцеговины заняли римляне, которые превратили ее в часть крупной провинции Иллирик.
В 6–7 вв. хорваты и сербы, захватили западные части Балканского полуострова, принадлежавшие Восточной Римской (Византийской) империи, и славянизировали иллирийское население.
Первоначально Босния, располагавшаяся в верховьях реки Босна, находилась в вассальном подчинении у Рашки (Сербии). После 960 она стала самоуправляемой территорией. В 1018 Византия установила номинальную власть над Боснией.
В начале 12 века Венгрия оккупировала часть Боснии, включая долину реки Рама. Венгерский король получил титул «Ramae rex» (король Рамы, т.е. Боснии) и назначил банов (наместников короля) для управления провинцией. После кратковременного периода контроля со стороны Византии бан Кулин Боснийский (правил в 1180–1204) вновь признал власть Венгрии.
В 1203 папский легат обязал Кулина и старейшин монастырских общин, называвшихся просто крстяни (христиане), отказаться от ереси и признать главенство Римско-католической церкви. После смерти Кулина Венгрия предприняла ряд крестовых походов против «боснийских еретиков» и в 1250 привела банов к подчинению. Твртко I Котроманич (правил 1353–1391) начавший свое правление как бан и вассал Венгрии, с 1377 года стал королем.
В 13–14 вв. баны и короли Боснии расширили территорию, которая стала последним большим средневековым королевством южных славян. Численности населения страны увеличилась за счет хорватов, а после приобретения Герцеговины (Хум или Хумская земля) страна получила выход к Адриатическому морю.
Босния и Герцеговина первыми из южнославянских областей были захвачены турками: Боснию в состав Османской империи включили в 1463 году, Герцеговину – в 1482 году. Последние боснийские территории (район Яйце) перешли к туркам в 1528 году.
Вся Босния и Герцеговина оставалась под властью османов вплоть до 1718 года, когда ее часть на два десятилетия отошла к Габсбургам.
Босния и Герцеговина становилась ареной соперничества хорватов и сербов. Из-за неурожая 1875 Герцеговину поразил голод. Часть страны выступало за объединение с Сербией, за объединение с Хорватией и за автономию. По решению Берлинского конгресса 1878 Босния и Герцеговина были переданы под власть Австро-Венгрии.