• Налоговый убыток, накопленный за время нахождения налогоплательщика на УСН, не может быть использован при переходе на ОСН. То есть, начав работать на УСН, компания рискует потерять «налоговый щит», который могла бы использовать в будущем, если бы изначально решилась на применение ОСН. При этом пониженная ставка налога на УСН (15% от разницы между доходами и расходами или 6% от доходов) может не компенсировать потерю «налогового щита», поскольку на старте бизнеса доходы, как правило, небольшие, тогда как расходы могут быть существенными.
• Если компания применяет УСН с момента основания (ранее не применяла ОСН), то для нее законодательно не определен порядок расчета остаточной стоимости основных средств при переходе на ОСН: согласно существующей судебной практике, остаточная стоимость формируется как разница между ценой приобретения основного средства и износом, начисленным по правилам УСН. То есть если компания переходит с УСН на ОСН, она также может потерять право на налоговые вычеты в части остаточной стоимости основных средств.
• Если объект основных средств введен в эксплуатацию в период нахождения компании на УСН, то при переходе на ОСН компания не вправе возместить из бюджета сумму НДС, относящуюся к несамортизированной части такого основного средства.
• Состав расходов, принимаемых для целей уменьшения налоговой базы по УСН, органичен расходами, прямо поименованными в Налоговом кодексе РФ. Судебная практика также подтверждает, что перечень вычитаемых расходов для целей УСН является закрытым. В этой связи компания может столкнуться с ситуацией, когда какая-то статья расходов будет невычитаемой, следовательно, эффективная налоговая ставка при расчете УСН как «доходы минус расходы» может стать существенно больше, чем законодательно установленные 15%. Напомним, что на ОСН при расчете налога на прибыль налогоплательщик вправе учесть все экономически обоснованные и документально подтвержденные расходы, за исключением расходов, прямо поименованных в Налоговом кодексе РФ как невычитаемые (расходы сверх норм, расходы социального характера и др.).
• Перенос налоговых убытков по УСН ограничен 10 годами, тогда как при применении ОСН срок переноса убытков для целей налога на прибыль не органичен (при этом действует ограничение, запрещающее при переносе убытков уменьшать налогооблагаемую прибыль отчетного периода больше, чем на 50%). То есть если компания ведет проекты с длительным сроком окупаемости и существенными затратами в начале (например, сложные НИОКР), УСН может оказаться менее привлекательным, чем ОСН.