.
Третий этап начинался после вторжения на территорию СССР основных сил противника. С началом приграничных боев и сражений пограничные войска должны были перейти в оперативное подчинение командования войск Красной Армии и действовать по его указаниям. Конкретные задачи погранвойск на этом этапе, как правило, не определялись. В некоторых планах предусматривалось, что пограничники, действуя самостоятельно на отдельных направлениях, будут прикрывать выдвижение главных сил армий к границе.
С началом войны пограничным войскам пришлось решать следующие основные задачи: вести боевые действия с разведывательными подразделениями и передовыми частями противника непосредственно на линии государственной границы; выполнять роль боевого охранения частей и соединений первого эшелона армий прикрытия; участвовать в боевых действиях в составе частей и соединений войск прикрытия при отступлении; осуществлять разведывательно-диверсионную деятельность в тылу противника и на маршрутах его движения; выявлять и уничтожать диверсионно-разведывательные группы противника, авиадесанты в боевых порядках и ближайшем тылу отходящих и обороняющихся войск.
22 июня 1941 г. пограничники вступили в бой с передовыми отрядами и разведывательными подразделениями врага. Высокое мужество проявили воины пограничных войск НКВД БССР под командованием генерал-лейтенанта И. А. Богданова. Охраняя участок государственной границы от побережья Балтийского моря в Литве до Украины, они оказались на направлении главного удара немецких войск. В первые часы войны мужество, стойкость и отвагу проявили пограничники 105-го Кретингского (начальник отряда – майор Бочаров Петр Никифорович, начальник штаба – капитан Зорин Дмитрий Герасимович, батальонный комиссар Лесняков Иван Ефимович), 106-го Таурагенского (начальник отряда – подполковник Головкин Леонтий Афанасьевич; начальник штаба – майор Герасимов Алексей Иванович; батальонный комиссар Иванов Александр Николаевич), 107-го Мариямпольского (начальник отряда – майор Шалымагин Петр Семенович; начальник штаба – капитан Григорьев Александр Сергеевич; батальонный комиссар Тиканов Александр Федорович), 86-го Августовского (начальник отряда – полковник Здорный Гурий Константинович; начальник штаба – капитан Янчук Иван Александрович; батальонный комиссар Герасименко Иван Георгиевич), 87-го Ломжанского (начальник отряда – полковник Горбатюк Иван Маркович; начальник штаба – майор Кольцов Павел Васильевич; батальонный комиссар Земляков Яков Иванович), 88-го Шепетовского (начальник отряда – майор Зиновский Антон Степанович; начальник штаба – майор Иванов Василий Платонович; батальонный комиссар Коновалов Павел Георгиевич), 17-го Краснознаменного Брестского (начальник отряда – майор Кузнецов Александр Петрович; начальник штаба – майор Кудрявцев Дмитрий Ильич; батальонный комиссар Ильин Ефим Ильич). Тысячи советских пограничников погибли в первые дни Великой Отечественной войны. Судьба многих и многих до сих пор практически неизвестна. Тем не менее, доподлинно известно и то, что ни одна пограничная застава не побежала в панике, не отступила без приказа. Все они дрались за каждую пядь родной земли мужественно и стойко – как и подобает пограничникам.