Неугодных индейцев отправляли на работы. Бывали случаи, что половина племени принимала христианство и приобретало свободу, а вторая истреблялась или отправлялась трудиться на плантации. От безысходности в некоторых рабовладениях вспыхивали восстания индейцев, которые быстро гасили. Самое крупное восстание было в 1686 году под руководством вождя Канинде племен жандуины и карири. Восставшим удалось победить в нескольких вооруженных сражениях.
Тяжелый изнурительный труд приводил к тому, что индейцы «дохли, как мухи». Усугубляли проблему эпидемии. Европейцы привезли вместе с собой болезни, которых до этого в лесах амазонки не было. Простой вирус гриппа, при отсутствии иммунитета к нему, убивал местных жителей один за другим. Численность индейцев сократилось к минимуму.
К слову, сейчас, в современное время, популяция индейцев на территории Бразилии существует, но в очень малых группах. Государство выделило для них заповедник Xingu, там они обитают и охраняются. Из выживших племен остались: Aweti, Kalapalo, Kamaiurá, Kayapó, Kuikuro, Matipu, Mehinako, Nahukuá, Suya, Trumai, Wauja и Yawalapiti – они живут согласно схожим традициям до колонизации.
По итогу рабов для осуществления работ в промышленных объемах не хватало. Проблему с рабочей силой надо было решать. Для этого рабов стали привозить из африканских стран, где у португальцев также были колонии.
Первые черные рабы были привезены еще в 1530 году при освоении земли Святого Креста. С расширением колоний поставки рабов стали увеличиваться. Для работ в Бразилии отбирались самые крепкие мужчины черного населения. Это были в основном выходцы из Западной Африки из племен мандинге, сонгаи, мосси, хауса – так как они были сильные и высокого роста. Позднее сила и свободолюбие этих черных рабов неоднократно создаст проблемы, поскольку придется гасить восстания и отлавливать сбежавших рабов будет сложно. Рабы из этих племен превосходили по силе португальцев и давали мощный отпор.
Черное население завозили в основном в три порта: Сальвадор, Ресифи и Рио. Завозили в несколько заходов из разных районов Африки. По выше упомянутой причине, поставку рабов начинают делать из других племен. Рабов начали поставлять из племен йоруба и дагомея, следующий поток из конго и кимбунду и заключительный из анголы, конго и мозамбика. Именно эти племена повлияют прямым образом на формирование бразильской культуры, национальной музыки и танцев.