Одним из главных критиков отчета Кондона была общественная организация наблюдателей НЛО – Национальный комитет исследователей воздушных явлений (National Investigators Committee for Aerial Phenomena – NICAP). Как показано в отчете Кондона, NICAP в прошлом потратил много усилий в попытках воздействовать на политику ВВС и конгресса в области изучения НЛО. NICAP приложил определенные усилия, чтобы повлиять на работу членов группы Кондона, а когда стало ясно, что это не удалось, NICAP назвал отчет «пристрастным» и не заслуживающим доверия. Национальная академия наук поддержала отчет Кондона и согласилась с его заключениями, сообщив о том, что методология отчета была правильна, а его заключения справедливы. Академия наук также согласилась с рекомендацией отчета о прекращении проекта «Синяя книга».
Несмотря на то что многие критиковали заключения и рекомендации отчета, никто не отрицал, что это наиболее совершенный и полный обзор проекта «Синяя книга», когда-либо предпринятый. Опираясь на выводы отчета Кондона, ВВС объявили 17 декабря 1969 г. о завершении проекта «Синяя книга» и отправке его отчетов в архив ВВС (авиабаза Максуэлл, шт. Алабама).
За 22 года существования проектов «Знак», «Недовольство» и «Синяя книга» было исследовано 12 618 сообщений о наблюдениях НЛО, из них только около 6 % наблюдений были признаны необъяснимыми. Еще в 1953 г. исследовательская группа, работавшая в составе этих проектов, пришла к четкому выводу, что все случаи наблюдения «летающих тарелок» могут быть объяснены «вполне земными причинами, поэтому нет оснований для того, чтобы прибегать к «услугам» пришельцев из космоса». Казалось бы, после такого длительного и основательного изучения проблему НЛО можно закрыть.
Однако закрывать эту тему командование ВВС не собиралось. Дело в том, что параллельно с группой Кондона работала группа специалистов из университета ВВС (авиабаза Максуэлл, шт. Алабама) под руководством подполковника Д. Даунинга. Член этой группы капитан Д. Стэнлей в июне 1968 г. представил доклад UFOs and extraterrestrial life («НЛО и внеземная жизнь»), специально подготовленный для руководящего и преподавательского состава университета. Этот доклад был полностью посвящен рассуждениям о внеземном происхождении НЛО. В главе VI сообщается о том, что: