Рукописи под названием «Сказание о перепущении вод» были рассчитаны на аптекарей. В XVI–XVII вв. в крупных центрах (Киев, Москва, Полоцк, Вильно) существовала так называемая цеховая медицина. В Киеве цех цирюльников был своеобразной единственной школой медиков для народа (С.А. Верхратский, 1946). Цирюльники лечили зубные, венерические и кожные болезни. Для своего времени они были достаточно грамотными (после нескольких лет обучения), умели готовить простые и сложные лекарственные формы, используемые в лечении кожных заболеваний (трофических язв голеней и др.).
В XVII в. в России начала развиваться государственная медицина. По приказу царя Петра Первого создается Аптекарский приказ (ведомство по вопросам здравоохранения). Возникают казенные аптеки и сырьевые базы для них – «аптекарские огороды» (1713). Один из них – «Санкт-Петербургский аптекарский огород» – впоследствии был преобразован в ботанический сад. Растительное лекарственное сырье заготавливали по всей России. Например, корни и траву консолиды (окопника) пудами отправляли в Москву. Царские войска частично обеспечивались аптекарскими препаратами растительного происхождения со складов Полоцка, Лубны и Могилева.
Ученые России в то время начали активно изучать отечественные лекарственные растения. Так, выдающийся и талантливейший основатель и систематизатор отечественной ботаники академик П.С. Паллас в 1773 г. писал: «Многие домашние лекарства, простым народом или дикими непросвещенными людьми случаем открытые, в руках врача время от времени становятся спасительными средствами». Под его руководством и с его участием в конце XVIII в. Академия наук организует научные экспедиции в различные уголки страны. Из крупных произведений научной мысли XVIII в. следует отметить «Дневные записки путешествия доктора и Академии наук адъюнкта Ивана Лепехина по разным провинциям Российского государства» (т. 1–4; 1771–1805).
В XIX в. все больше внимания уделяется народным (традиционным) средствам лечения. Появляются медико-географические описания, труды Вольного экономического, Русского географического и Сельскохозяйственного обществ. Вольное экономическое общество на страницах своего печатного органа обращало внимание врачей на использование растительных средств от псориаза, потливости, чесотки, экземы, крапивницы и других заболеваний. Среди 700 статей с описанием лекарственных растений, употреблявшихся в народной и научной медицине, можно встретить «О лекарстве от лишаев», «Лечение лишайной сыпи новым действительнейшим против нее средством, именно растением цмин или золотолистка», «О действии хмеля в лишайных сыпях» и др.