Во время освящения поклонного креста в Ачаирском монастыре, а было это в пасмурную дождливую погоду, произошло чудо – на евангелие в руках владыки Феодосия сквозь тучи вдруг упал солнечный луч.
В 1913 году новый монастырь благословил архиепископ Андроник.
С приходом советской власти все изменилось. В августе 1920 года была арестована настоятельница монастыря игуменья Евпраксия Рождественская. Церковное имущество было конфисковано и разграблено, и монастырь прекратил свое существование.
В 1991 году эти края посетил владыка Феодосий. Настоятель Ачаирской Никольской церкви отец Александр (Горбунов) поведал страшную историю обители, показал место нахождения бывшего монастыря, рвы и развалины бараков, оставшиеся в наследство от ГУЛАГа, и сад, посаженный заключенными.
26 октября 1992 году был установлен закладной крест, и владыка Феодосий совершил панихиду по убиенным и замученным и благословил строительство женского монастыря во имя Животворящего Креста Господня.
В сентябре 1993 года строительство монастыря освятил патриарх Алексий II, посетивший строящийся монастырь.
На сегодняшний день вокруг Ачаирского монастыря построена ограда с 4 вратами: Иртышские, Северные – вход в монастырь, Восточные и Западные. На территории воздвигнуты 7 храмов, 5 часовен, а также кельи для монахинь, трапезная и монастырская гостиница для паломников. Для собственных нужд монахини выращивают зерно, картофель и овощи, а также разводят животных и птиц.