Не обошли награды и самого директора: он был награжден Почетным знаком ГДР «За заслуги в народном образовании», знаками «Отличник народного просвещения РСФСР» и «Отличник просвещения СССР».
В 1991 году Ильяс Иштуганович покинул пост директора родной ему школы-интерната, чтобы принять ключи от уфимской школы-новостройки № 124, с которой он связал свою судьбу последующие девять лет. Именно будучи руководителем этой школы, он защитил сначала кандидатскую, а затем (впервые в истории образования республики и четвертый в бывшем Советском Союзе) и докторскую степени по педагогике.
Вскоре в 1995 г. он был избран действительным членом (академиком) Академии педагогических и социальных наук, а год спустя – Международной педагогической академии.
Огромному запасу энергии, инициатив, креативности и даже изобретательности этого человека просто поражаешься! За описываемые годы он успел не только стать академиком и первым в Башкортостане директором – доктором наук, но и практически с нуля создал новое детище при школе – ученический завод «Светэл».
Но разве мог наш герой остановиться на достигнутом? Конечно же, нет. В начале нового века Ильяс Иштуганович переходит на преподавательскую деятельность в вуз – он становится профессором Башкирского государственного аграрного университета. Именно в это время благодаря его чаяниям, его неутомимому труду и пробивной силе был открыт лицей Башгосаграруниверситета, символический ключ от которого был вручен ему в качестве директора 1 сентября 2002 года. Одновременно он работает в должности проректора университета по довузовской подготовке.
Ныне И. И. Валеев заведует вновь открытой кафедрой педагогики и психологии Уфимской государственной академии экономики и сервиса (ранее – Уфимский государственный институт сервиса).
За заслуги в педагогической науке Ильяс Валеев был удостоен высшей педагогической награды страны – медали имени К. Д. Ушинского и знака «Почетный работник общего образования РФ». За цикл этнопедагогических исследований ему была вручена Международная премия имени академика Г. Н. Волкова, а за монографию «Народность и патриотизм» – премия имени Степана Злобина. Также он награжден медалью М. М. Джалиля за труды по патриотическому воспитанию молодежи, а за монографии «Российская деревня в XX столетии» и «Духовная власть земли» – медалью имени Т С. Мальцева.