Часто употребляемые в связи с иммунитетом термины «информация», «память», «распознавание», определенно вызывают ассоциации с работой нервной системы. Действительно, многие исследователи иммунную систему определяют как «мобильный мозг». В то же время использование клетками иммунной системы молекул-посредников напоминает основанную на гормонах организацию эндокринной системы, которая в свою очередь связана с мозгом через систему «гипоталамус – гипофиз – надпочечники». На этом основании три системы (нервная, эндокринная, иммунная) можно рассматривать как часть единой интегральной сети. Ученые, работающие в этой области, применяют достаточно громоздкие термины: «психонейроиммуно-логическая» или «нейроэндокриноиммунологическая» системы. Существует множество подтверждений этой концепции. Известно, что стресс, тяжелые переживания ослабляют иммунное реагирование. Иммунитет реализует свое действие против разных противников разными способами. При этом если с основными закономерностями борьбы организма с вирусами и бактериями все более-менее ясно, то при «выяснении отношений» с грибами, простейшими и гельминтами начинаются серьезные «пробуксовки». Чем эволюционно более «продвинут» противник, тем чаще он «дурит» иммунитет.
Первые проблемы начинаются еще на уровне взаимодействия с бактериями. Если можно сказать, что антитела наиболее активны против микроорганизмов, свободно находящихся в крови или тканях, то иммунный ответ, реализуемый клеточными механизмами, имеет дело с микроорганизмами, проникшими в клетки. Какой из механизмов окажется эффективным, во многом зависит от поведения микроорганизма. При этом иммунная система высокоэффективна в распознавании чужеродных субстанций, но совершенно беспомощна в определении степени опасности, которую они могут представлять для организма. Отсюда – нежелательные побочные эффекты, например избыточный иммунный ответ против чужеродной, но не болезнетворной структуры, такой, как пыльца растений или банальная домашняя пыль. Выражается этот избыточный ответ в разнообразных аллергических реакциях.
Большая часть бактерий уничтожается в организме в результате фагоцитоза. Бактерии, в отличие от более высокоорганизованных организмов (от грибов до человека), являются прокариотами, поэтому их молекулы чужеродны для человека в большей степени, чем молекулы