Синод, изучив сложившуюся в Обдорском крае ситуацию, предписал не учреждать пока в Обдорске миссии, а послать туда священника, который смог бы привлечь к себе жителей края и подготовил почву для крещения их в будущем. Таким образом, жителям Обдорского края удалось отстоять своё право на традиционную религию и заставить представителей светской и духовной властей, пусть ненадолго, но всё же отступить.
Оживление миссионерской деятельности в Обдорском крае началось только в 1846 году с посещения Обдорска архиепископом Тобольским и Сибирским Георгием и назначением в Обдорскую церковь молодого священника, уроженца Севера Петра Александровича Попова (1825—1888 гг.), только что окончившего семинарию. Изучив особенности работы по распространению христианства в своём приходе, миссионер обратился в 1852 году к генерал-губернатору Западной Сибири с просьбой об учреждении в Обдорске походной церкви, которая была прислана спустя два года.
Эти походные церкви сыграли большую роль в деле крещения местных народов и получили высокую оценку миссионеров. Светская власть помогала миссионерам с транспортом и проводниками.
По решению Синода в 1854 году была вновь открыта Обдорская миссия.
П. А. Попов работал в Обдорске с 1846-го по 1868 год. Он разъезжал по берегам Оби, бывал в приуральской тундре, вёл беседы с инородцами, пользовался среди них уважением и авторитетом. Организовал и содержал на собственные средства миссионерскую школу, где обучались дети из числа русских и инородцев.
Напечатал «Словарь остяцко-самоедского языка» (1872 г.) и «Перевод на остяцкий язык Евангелия от Матфея» (1887 г.). Впоследствии за переводческие труды Попов удостаивается посвящения в сан протоиерея. А его переводы рассылаются по церквам.
После 22-летнего пребывания в Обдорске священник, миссионер, учитель, переводчик П. А. Попов 31 августа 1868-го отбывает в Тобольск священником в Иоанно-Введенский монастырь, но не бросает работу, начатую на Севере. В середине 70-х годов он приступает к составлению букваря. Зачастую епархиальное начальство обращалось к нему с просьбой перевода текстов молитв и священного писания на языки народов Севера.
Летом 1886-го состоялось очередное путешествие П. А. Попова на Север. Его цель – Обдорская миссия. После поездки был создан интересный документ – «Очерки быта инородцев Берёзовского края», где систематизирована краткая характеристика истории, быта, занятий, пищи, образа жизни и религиозности коренных народов Севера.